El virus de la sharka (PPV) es el factor limitante más importante para la producción de albaricoque (L.) a nivel mundial, y el desarrollo de cultivares resistentes ha demostrado ser la mejor solución a largo plazo. Sin embargo, al igual que en otras especies leñosas, el mejoramiento del albaricoque es altamente demandante en tiempo y espacio, y esto es especialmente cierto para la fenotipificación de resistencia al PPV. Por lo tanto, la selección asistida por marcadores (MAS) puede ser muy útil para acelerar los programas de mejoramiento. Los genes que contienen el dominio de homología meprina y TRAF-C (MATH) han sido propuestos como genes de susceptibilidad del hospedador necesarios para la infección por PPV. La contribución de genes adicionales a la resistencia al PPV no puede descartarse, pero todos los estudios disponibles muestran sin lugar a dudas una fuerte correlación entre los alelos resistentes y la resistencia al PPV. Se ha demostrado que el alelo lleva una deleción de 5 pb (-del) dentro del segundo exón que se ha caracterizado como un marcador molecular adecuado para MAS (PMC2). Basándonos en este hallazgo, proponemos aquí un método para la selección de resistencia al PPV en albaricoque mediante la combinación de extracción de ADN de alto rendimiento de 384 muestras en 2 días laborables y la genotipificación alelo-específica de PMC2 en gel de agarosa. Además, el genotipo de PMC2 se ha determinado mediante PCR o utilizando secuencias de genoma completo (WGS) en 175 accesiones de albaricoque. Estos resultados se complementaron con datos fenotípicos y/o genotípicos disponibles en la literatura para alcanzar un total de 325 accesiones de albaricoque. En conjunto, concluimos que este es un método eficiente en tiempo, rentable y directo para el cribado de resistencia al PPV que puede ser de gran utilidad para los programas de mejoramiento del albaricoque.