Se analizaron los cambios en la comunidad bacteriana, el fenotipo, la función metabólica y el contenido de bacterias patógenas en los sólidos de estiércol reciclado (RMS) mediante secuenciación de 16S rRNA, Bugbase, picrust2 y qPCR, respectivamente. Los datos de la cama de RMS se compararon con los de la cama de arena y la cama de cáscara de arroz. Los resultados muestran que la proporción de bacterias potencialmente patógenas entre la flora de estiércol de RMS después de la separación en seco y húmedo, después del compostaje y después del almacenamiento al sol fue del 74.00%, 26.03% y 49.067%, respectivamente. En comparación con la cama de RMS, la proporción de microorganismos potencialmente patógenos en la cama de arena y la cama de cáscara de arroz fue mayor. Los análisis de picrust2 muestran que el nivel de biosíntesis de lipopolisacáridos cambió significativamente durante el procesamiento de RMS. Además, los resultados de qPCR muestran que el compostaje podría reducir efectivamente la detección y cuantificación de patógenos, excepto en la cama de RMS. En general, el compostaje es un paso esencial para mejorar la seguridad de los materiales de cama en el proceso de tratamiento fecal. Sin embargo, al mismo tiempo, la cama de RMS puede aumentar el riesgo de mastitis causada por.