Segmentación de variantes de núcleos en imágenes de láminas completas mediante características radiómicas
Autores: Sheikh, Taimoor Shakeel; Cho, Migyung
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Segmentación de variantes de núcleos en imágenes de láminas completas mediante características radiómicas
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Histopatológico
Segmentación
Núcleos
Radiómica
Marco de trabajo
Clasificadores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 31
Citaciones: Sin citaciones
La segmentación histopatológica de tipos nucleares es una tarea desafiante porque los núcleos presentan morfologías, texturas y características de tinción distintas. La segmentación precisa es crítica porque afecta el flujo de trabajo diagnóstico para la evaluación de pacientes. En este estudio, se propuso un marco para segmentar varios tipos de núcleos de diferentes órganos del cuerpo. El marco propuesto mejoró el rendimiento de segmentación para cada tipo nuclear utilizando radiómica. Primero, se utilizaron características radiómicas distintas para extraer y analizar información cuantitativa sobre cada tipo de núcleo y posteriormente se entrenaron varios clasificadores basados en las mejores subcaracterísticas de entrada de cada característica radiómica seleccionadas por un operador LASSO. Segundo, se introdujeron las salidas del mejor clasificador a varios modelos de segmentación para aprender las variantes de núcleos. Utilizando el conjunto de datos MoNuSAC2020, logramos un rendimiento de segmentación de vanguardia para cada categoría de tipo de núcleos a pesar de la complejidad, superposición y regiones oscuras. La adaptabilidad generalizada del marco propuesto fue verificada por el rendimiento consistente obtenido en imágenes de toda la diapositiva de diferentes órganos del cuerpo y características radiómicas.
Descripción
La segmentación histopatológica de tipos nucleares es una tarea desafiante porque los núcleos presentan morfologías, texturas y características de tinción distintas. La segmentación precisa es crítica porque afecta el flujo de trabajo diagnóstico para la evaluación de pacientes. En este estudio, se propuso un marco para segmentar varios tipos de núcleos de diferentes órganos del cuerpo. El marco propuesto mejoró el rendimiento de segmentación para cada tipo nuclear utilizando radiómica. Primero, se utilizaron características radiómicas distintas para extraer y analizar información cuantitativa sobre cada tipo de núcleo y posteriormente se entrenaron varios clasificadores basados en las mejores subcaracterísticas de entrada de cada característica radiómica seleccionadas por un operador LASSO. Segundo, se introdujeron las salidas del mejor clasificador a varios modelos de segmentación para aprender las variantes de núcleos. Utilizando el conjunto de datos MoNuSAC2020, logramos un rendimiento de segmentación de vanguardia para cada categoría de tipo de núcleos a pesar de la complejidad, superposición y regiones oscuras. La adaptabilidad generalizada del marco propuesto fue verificada por el rendimiento consistente obtenido en imágenes de toda la diapositiva de diferentes órganos del cuerpo y características radiómicas.