Los ecosistemas agroecológicos producen flujos significativos de dióxido de carbono; sin embargo, el equilibrio de su secuestro de carbono, así como las tasas de emisión, enfrenta considerables incertidumbres. Por lo tanto, las prácticas agrícolas sostenibles representan una oportunidad única para el secuestro de carbono, compensando las emisiones de gases de efecto invernadero. En esta investigación, evaluamos el efecto a corto plazo de diferentes prácticas de manejo en calles (labranza, sin labranza, cultivo en calle con y sobre las propiedades del suelo, el secuestro de carbono y las emisiones de CO en un huerto de pomelos bajo clima semiárido). Durante dos años, cada cuatro meses, se realizaron campañas de muestreo de suelo, se midieron las emisiones de CO del suelo y se muestrearon suelos de la rizosfera al final del período experimental. Los resultados muestran que el cultivo en calle con y contribuyó a mejorar la fertilidad del suelo, aumentando el carbono orgánico del suelo (COS), el nitrógeno total, la capacidad de intercambio catiónico y los nutrientes. Las tasas de emisión de CO siguieron el patrón de temperatura/humedad del suelo. La labranza no contribuyó a mayores emisiones generales de CO, y no hubo disminución en los contenidos de COS. En contraste, los cultivos en calle aumentaron las tasas de emisión de CO, especialmente; sin embargo, el sistema radicular más grande y la biomasa de contribuyeron al secuestro de carbono del suelo a un ritmo mayor que . Por lo tanto, se posiciona como una mejor opción que para ser utilizado como cultivo en calle, aunque se requiere un monitoreo a largo plazo para evaluar si los beneficios a corto plazo reportados se mantienen con el tiempo.