Los estudios previos sobre la vía biosintética de antocianinas (ABP) observaron que el módulo miR156-SPL9 contribuye a la formación de puntas blancas en los pétalos de dalia al reprimir el complejo MYB-bHLH-WDR. En este estudio, detectamos la posible regulación post-transcripcional involucrada en la formación de pétalos bicolor mediante el secuenciamiento de ARN pequeño de bases rojas y puntas blancas. Comparado con las bases rojas, se identificaron 89 miARNs diferencialmente expresados y 6349 genes diana. Y 78 miARNs sobreexpresados con sus 249 genes diana subexpresados estuvieron involucrados en el proceso de formación de puntas blancas en los pétalos. Los genes diana de los miARNs diferencialmente expresados se enriquecieron significativamente en los ABPs y los miARNs de seis familias conservadas (MIR 156, 164, 167, 169, 482 y 6114) dirigidos a cuatro familias de factores de transcripción (ARF, HD-ZIP, SBP y NAC) estuvieron involucrados en el silenciamiento génico post-transcripcional (PTGS) de la ABP. El análisis de secuenciación de transcripción y PCR cuantitativa de transcripción inversa demostraron que el módulo MIR167-ARF8 y el módulo MIR6114-ANL2 eran los reguladores candidatos de la ABP inactiva en las puntas blancas al deprimir la transcripción de múltiples genes estructurales. Los hallazgos proporcionaron nuevas perspectivas sobre la regulación post-transcripcional de la ABP y serían valiosos para estudios futuros de los mecanismos de PTGS de la formación de pétalos bicolor.