Los microorganismos intestinales están estrechamente relacionados con la salud, el desarrollo y el rendimiento productivo de los animales, y también pueden proporcionar información básica para que podamos comprender y explorar completamente las características y rasgos del germoplasma de las razas de gallinas locales. En este experimento, utilizamos cinco razas de gallinas chinas locales como materiales de investigación; se utilizó tecnología de secuenciación metagenómica para explorar las diferencias en la composición de microorganismos intestinales en diferentes razas, y se encontró que cada raza de gallina local tenía unigenes únicos, de los cuales los Silkie tenían la mayor cantidad, con un total de 12,948. Los análisis de GO y KEGG encontraron que los procesos biológicos más enriquecidos por genes funcionales diferenciales incluyen la codificación genética, el transporte macromolecular, la síntesis de proteínas y funciones moleculares como la unión de glicoproteínas, la hidrólisis de proteínas, etc. Cada raza está enriquecida con rutas específicas, como las gallinas grises tipo Anyi, que están enriquecidas con rutas relacionadas con la resistencia a enfermedades, mientras que el enriquecimiento de los gallos de pelea está relacionado con el metabolismo de aminoácidos. Los análisis de Random Forest y LEfSe revelaron especies específicas de microorganismos intestinales en el ciego de diferentes razas, como , que está asociado con la deposición de melanina en los Silkie. Por lo tanto, inferimos que los microorganismos intestinales están estrechamente relacionados con la formación de las características de las razas de gallinas, y los resultados de este experimento pueden proporcionar una base teórica para el descubrimiento de rasgos de alta calidad y la mejora de las condiciones de alimentación en el futuro.