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Secuenciación y análisis del genoma mitocondrial completo de

Autores: Sun, Cheng-He; Gu, Yang-Liang; Liu, Da-Wei; Du, Hong-Wei; Lu, Chang-Hu

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Secuenciación y análisis del genoma mitocondrial completo de


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Genoma mitocondrial
Sicydiinae
Relaciones filogenéticas
PCGs
GenBank
Secuencia

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Secuenciamos y analizamos el genoma mitocondrial completo de y exploramos las relaciones filogenéticas entre Sicydiinae basándonos en las secuencias del genoma mitocondrial. La secuencia completa del genoma mitocondrial de se determinó utilizando la plataforma de secuenciación Illumina HiSeq X Ten, y se analizaron las características estructurales de los genes y la composición de bases. Basándonos en las secuencias del genoma mitocondrial de 28 especies de Sicydiinae publicadas en GenBank y en los genes codificadores de proteínas mitocondriales (PCGs), se seleccionó (Gobionellinae) como grupo externo para construir árboles filogenéticos de Sicydiinae utilizando los métodos de máxima verosimilitud e inferencia bayesiana. El genoma mitocondrial de (número de GenBank: OP764680) tiene una longitud total de 16,498 pb y codifica 13 PCGs, 22 genes de ARN de transferencia, dos genes de ARN ribosómico y una región D-loop (control). No se observa reordenamiento de genes. El genoma mitocondrial de presenta una preferencia por AT, con un sesgo AT > 0 y un sesgo GC < 0 en todo el genoma. Las relaciones filogenéticas de Sicydiinae basadas en 13 secuencias de PCG mitocondriales son + ( + ( + )) + , lo que indica que , , , y son grupos monofiléticos.

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