Aunque varios estudios han descrito la composición de la comunidad bacteriana asociada con los peces marinos, hay información limitada relacionada con los caballitos de mar. Además, estudios previos han demostrado que la microbiota de la piel es útil para determinar el estado de salud y los trastornos comunes en el huésped. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo explorar la composición de la comunidad bacteriana de la piel en el caballito de mar de Barbour utilizando secuenciación de alto rendimiento de genes de ARN ribosómico 16S. También se analizaron muestras de agua y sedimento del entorno circundante con fines comparativos. Los resultados revelaron que las secuencias afiliadas a la familia eran dominantes en la piel de las hembras de caballito de mar de Barbour y en las muestras de sedimento, mientras que las secuencias afiliadas a la familia eran dominantes en la piel de los machos de caballito de mar de Barbour. Curiosamente, se encontraron secuencias afiliadas al género en la piel de los caballitos de mar de Barbour, cuya abundancia era ligeramente similar entre los especímenes femeninos y masculinos. Un análisis comparativo adicional mostró que la presencia de especies en la piel de los caballitos de mar de Barbour estaba fuertemente influenciada por el sedimento circundante. Dado que se sabe que algunas especies son patógenos importantes en humanos y peces, estos resultados pueden ser utilizados para investigaciones futuras sobre la dependencia de la composición microbiana de la piel en el medio ambiente, así como para determinar si la presencia de y otras especies detectadas tiene implicaciones en la salud de los caballitos de mar.