Secuenciación de todo el exoma en tríos familiares revela mutaciones de novo asociadas con la diabetes mellitus tipo 1
Autores: Mousa, Mira; Albarguthi, Sara; Albreiki, Mohammed; Farooq, Zenab; Sajid, Sameeha; El Hajj Chehadeh, Sarah; ElBait, Gihan Daw; Tay, Guan; Deeb, Asma Al; Alsafar, Habiba
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Secuenciación de todo el exoma en tríos familiares revela mutaciones de novo asociadas con la diabetes mellitus tipo 1
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Diabetes mellitus
Enfermedad autoinmune
Deficiencia de insulina
Células beta de los islotes pancreáticos
Mutaciones de novo
Secuenciación del exoma completo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La diabetes mellitus tipo 1 (T1DM) es una enfermedad autoinmune crónica caracterizada por deficiencia de insulina y pérdida de células beta de los islotes pancreáticos. El objetivo de este estudio es identificar mutaciones de novo en 13 tríos de familias singleton que contribuyen a la base genética de la T1DM mediante la aplicación de secuenciación de exomas completos (WES). De las 13 familias muestreadas para este proyecto, 12 tenían variantes de novo, siendo la Familia 7 la que tenía el mayor número (nueve) de variantes vinculadas a vías de T1DM/autoinmunidad, mientras que la Familia 4 no tenía ninguna variante después de los pasos de filtrado. Hubo 10 variantes de 7 genes que se informaron como asociadas con T1DM. Hubo 20 variantes de 13 genes que estaban vinculadas a enfermedades endocrinas, metabólicas o autoinmunes. Nuestros hallazgos demuestran que la WES basada en tríos es un enfoque poderoso para identificar nuevos genes candidatos para la patogénesis de la T1D. Se recomienda la genotipificación y la anotación funcional de las variantes de novo descubiertas en una gran cohorte para determinar su asociación con la patogénesis de la enfermedad.
Descripción
La diabetes mellitus tipo 1 (T1DM) es una enfermedad autoinmune crónica caracterizada por deficiencia de insulina y pérdida de células beta de los islotes pancreáticos. El objetivo de este estudio es identificar mutaciones de novo en 13 tríos de familias singleton que contribuyen a la base genética de la T1DM mediante la aplicación de secuenciación de exomas completos (WES). De las 13 familias muestreadas para este proyecto, 12 tenían variantes de novo, siendo la Familia 7 la que tenía el mayor número (nueve) de variantes vinculadas a vías de T1DM/autoinmunidad, mientras que la Familia 4 no tenía ninguna variante después de los pasos de filtrado. Hubo 10 variantes de 7 genes que se informaron como asociadas con T1DM. Hubo 20 variantes de 13 genes que estaban vinculadas a enfermedades endocrinas, metabólicas o autoinmunes. Nuestros hallazgos demuestran que la WES basada en tríos es un enfoque poderoso para identificar nuevos genes candidatos para la patogénesis de la T1D. Se recomienda la genotipificación y la anotación funcional de las variantes de novo descubiertas en una gran cohorte para determinar su asociación con la patogénesis de la enfermedad.