La resecuenciación del genoma completo se ha aplicado cada vez más a la cría genética de ganado vacuno. Como una raza indígena superior en la provincia de Henan, el ganado Pinan exhibe un crecimiento rápido, una madurez sexual temprana y un alto porcentaje de rendimiento, lo que lo convierte en un componente importante de los recursos genéticos de ganado vacuno local en China. Sin embargo, su variación genómica sigue estando poco caracterizada. Aquí, realizamos una resecuenciación del genoma completo en el ganado Pinan para evaluar la diversidad genética y llevamos a cabo un análisis de barrido selectivo para identificar genes y loci candidatos vinculados a rasgos económicos clave. Este estudio proporciona información sobre la base molecular de los rasgos superiores del ganado Pinan y apoya la cría asistida por marcadores para el crecimiento y el rendimiento reproductivo.