Secuenciación del Genoma Mitocondrial Completo y Construcción del Árbol Filogenético para (Lin 1933)
Autores: Li, Zhe; Han, Yaoquan; Li, Yusen; Wu, Weijun; Lei, Jianjun; Wang, Dapeng; Lin, Yong; Wang, Xiaoqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Secuenciación del Genoma Mitocondrial Completo y Construcción del Árbol Filogenético para (Lin 1933)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Carpa de tinta china
Genomas mitocondriales
Análisis filogenético
Genes que codifican proteínas
Polimorfismos de un solo nucleótido
Conservación de recursos
Licencia
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Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
(Lin, 1933), también conocido como el carpa de tinta china, actualmente tiene un estatus de protección de segunda clase en China. Comprender la estructura y características de los genes mitocondriales proporciona información esencial para la conservación de recursos y estudios filogenéticos de . Aquí, secuenciamos los genomas mitocondriales de tres (WYL1-3) de tres sitios y realizamos un análisis filogenético. Los tres genomas generados tenían una longitud de 16,587 pb, que comprende 13 genes que codifican proteínas (PCGs), 22 tRNAs, dos rRNAs y dos regiones no codificantes (región de control (CR), D-loop y inicio de replicación de cadena ligera OL), con una preferencia por los codones que terminan en A o C. Los genomas mitocondriales de WYL2 y WYL3 eran idénticos, diferenciándose del de WYL1 por solo cinco polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs). Todos los PCGs mitocondriales tenían razones Ka/Ks de menos de uno, lo que sugiere selección purificadora. El análisis del árbol filogenético basado en secuencias de aminoácidos sugirió que el género es hermana de todos los demás géneros de la subfamilia Cyprinidae de China; el género forma un grupo monofilético; y los géneros , , y forman un grupo monofilético. Este estudio contribuye a nuestra comprensión de las relaciones filogenéticas en la subfamilia Cyprininae en China y sienta las bases para la conservación y gestión de recursos de .
Descripción
(Lin, 1933), también conocido como el carpa de tinta china, actualmente tiene un estatus de protección de segunda clase en China. Comprender la estructura y características de los genes mitocondriales proporciona información esencial para la conservación de recursos y estudios filogenéticos de . Aquí, secuenciamos los genomas mitocondriales de tres (WYL1-3) de tres sitios y realizamos un análisis filogenético. Los tres genomas generados tenían una longitud de 16,587 pb, que comprende 13 genes que codifican proteínas (PCGs), 22 tRNAs, dos rRNAs y dos regiones no codificantes (región de control (CR), D-loop y inicio de replicación de cadena ligera OL), con una preferencia por los codones que terminan en A o C. Los genomas mitocondriales de WYL2 y WYL3 eran idénticos, diferenciándose del de WYL1 por solo cinco polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs). Todos los PCGs mitocondriales tenían razones Ka/Ks de menos de uno, lo que sugiere selección purificadora. El análisis del árbol filogenético basado en secuencias de aminoácidos sugirió que el género es hermana de todos los demás géneros de la subfamilia Cyprinidae de China; el género forma un grupo monofilético; y los géneros , , y forman un grupo monofilético. Este estudio contribuye a nuestra comprensión de las relaciones filogenéticas en la subfamilia Cyprininae en China y sienta las bases para la conservación y gestión de recursos de .