Secuenciación del Genoma Mitocondrial Completo de la Almeja Big Brown Mactra, (Venerida: Mactridae)
Autores: Ma, Peizhen; Liu, Zhihong; Li, Zhuanzhuan; Sun, Xiujun; Zhou, Liqing; Wu, Xiangyu; Wu, Biao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Secuenciación del Genoma Mitocondrial Completo de la Almeja Big Brown Mactra, (Venerida: Mactridae)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Genomas mitocondriales
Taxonomía de moluscos
Germoplasma
Estudios de evolución
Genes que codifican proteínas
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los genomas mitocondriales están desempeñando un papel cada vez más importante en la taxonomía de los moluscos, el germoplasma y los estudios de evolución. El primer genoma mitocondrial completo de la almeja comercial mactra marrón grande fue caracterizado utilizando secuenciación de próxima generación Illumina en este estudio. El genoma circular de 17,289 pb tiene una organización génica típica de 13 genes que codifican proteínas (PCGs), 2 rARN y 22 tARN, con un sesgo obvio de (A + T) del 64.54%. Todos los PCGs mostraron un sesgo homogéneo en la composición de nucleótidos con un sesgo de (A + T), un sesgo GC positivo y un sesgo AT negativo. Los resultados del análisis filogenético mostraron que estaba más estrechamente relacionado con . La disposición funcional de los genes de las dos especies era idéntica pero diferente de otras especies. Las relaciones congéneres entre las especies fueron demostradas por el análisis de distancia genética. Además, el análisis de presión selectiva sugirió que era altamente eficiente para discriminar especies estrechamente relacionadas en el género , mientras que era el marcador más apropiado para el análisis genético poblacional.
Descripción
Los genomas mitocondriales están desempeñando un papel cada vez más importante en la taxonomía de los moluscos, el germoplasma y los estudios de evolución. El primer genoma mitocondrial completo de la almeja comercial mactra marrón grande fue caracterizado utilizando secuenciación de próxima generación Illumina en este estudio. El genoma circular de 17,289 pb tiene una organización génica típica de 13 genes que codifican proteínas (PCGs), 2 rARN y 22 tARN, con un sesgo obvio de (A + T) del 64.54%. Todos los PCGs mostraron un sesgo homogéneo en la composición de nucleótidos con un sesgo de (A + T), un sesgo GC positivo y un sesgo AT negativo. Los resultados del análisis filogenético mostraron que estaba más estrechamente relacionado con . La disposición funcional de los genes de las dos especies era idéntica pero diferente de otras especies. Las relaciones congéneres entre las especies fueron demostradas por el análisis de distancia genética. Además, el análisis de presión selectiva sugirió que era altamente eficiente para discriminar especies estrechamente relacionadas en el género , mientras que era el marcador más apropiado para el análisis genético poblacional.