Secuenciación de Tiempo-Curso Transcriptómica: Perspectivas sobre la Dehiscencia de Frutos Mediadas por Macromoléculas de la Pared Celular durante la Maduración en
Autores: Sheng, Yu; Yao, Xiaohua; Liu, Linxiu; Yu, Chunlian; Wang, Kunxi; Wang, Kailiang; Chang, Jun; Chen, Juanjuan; Cao, Yongqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Secuenciación de Tiempo-Curso Transcriptómica: Perspectivas sobre la Dehiscencia de Frutos Mediadas por Macromoléculas de la Pared Celular durante la Maduración en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cultivos de aceite leñosos comestibles
Aceite de semilla
Dehiscencia de frutos
Secuenciación transcriptómica
Modificación de la pared celular
Hidrolasas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
(), uno de los cuatro principales cultivos leñosos comestibles de aceite del mundo, se ha plantado ampliamente en la región subtropical del sur de China debido a los extremadamente altos beneficios nutricionales y de salud de su aceite de semilla. El momento y la sincronización de la dehiscencia del fruto son factores críticos que influyen en la producción y calidad del aceite, así como en la eficiencia y el costo de la cosecha, sin embargo, carecen de atención. Para comprender la base molecular subyacente a la dehiscencia del fruto, muestreamos tejidos de pericarpo-replum que contenían zonas de dehiscencia de frutos en diferentes etapas de desarrollo y realizamos secuenciación y análisis transcriptómico en serie temporal por primera vez. El análisis estadístico y de enriquecimiento de GO de los genes expresados diferencialmente reveló que ocurrieron cambios transcripcionales drásticos durante el último corto intervalo de muestreo (4 días, del 18 al 22 de octubre), que dirigieron clasificaciones funcionales relacionadas con la actividad de la pared celular y macromoléculas de la pared celular. WGCNA mostró además que los factores que controlan la modificación de la pared celular, incluyendo endo-1,3;1,4-beta-D-glucanasa, proteína similar a WAT1 37, quinasa de serina/treonina similar a LRR y subunidad catalítica de la celulosa sintasa A, fueron identificados como miembros centrales de la red de coexpresión de los módulos altamente relacionados en la última etapa. Además, en estos módulos, también notamos genes que fueron anotados como codificadores de poligalacturonasa y pectinesterasa, dos pectinasa que se esperaba que fueran actores principales en la separación celular durante la dehiscencia. qRT-PCR confirmó además los perfiles de expresión de estos factores relacionados con la modificación de la pared celular, que poseían una abundancia transcripcional especial alta en la etapa final. Estos resultados sugieren que la separación celular asociada a la pared celular, uno de los procesos esenciales posteriores a la dehiscencia del fruto, ocurrió en frutos en dehiscencia durante la maduración. Las hidrolasas que actúan sobre los componentes de la pared celular son buenos candidatos para mediar la señal de dehiscencia del fruto. En conclusión, nuestro análisis proporcionó información sobre la dehiscencia del fruto mediada por macromoléculas de la pared celular durante la maduración en .
Descripción
(), uno de los cuatro principales cultivos leñosos comestibles de aceite del mundo, se ha plantado ampliamente en la región subtropical del sur de China debido a los extremadamente altos beneficios nutricionales y de salud de su aceite de semilla. El momento y la sincronización de la dehiscencia del fruto son factores críticos que influyen en la producción y calidad del aceite, así como en la eficiencia y el costo de la cosecha, sin embargo, carecen de atención. Para comprender la base molecular subyacente a la dehiscencia del fruto, muestreamos tejidos de pericarpo-replum que contenían zonas de dehiscencia de frutos en diferentes etapas de desarrollo y realizamos secuenciación y análisis transcriptómico en serie temporal por primera vez. El análisis estadístico y de enriquecimiento de GO de los genes expresados diferencialmente reveló que ocurrieron cambios transcripcionales drásticos durante el último corto intervalo de muestreo (4 días, del 18 al 22 de octubre), que dirigieron clasificaciones funcionales relacionadas con la actividad de la pared celular y macromoléculas de la pared celular. WGCNA mostró además que los factores que controlan la modificación de la pared celular, incluyendo endo-1,3;1,4-beta-D-glucanasa, proteína similar a WAT1 37, quinasa de serina/treonina similar a LRR y subunidad catalítica de la celulosa sintasa A, fueron identificados como miembros centrales de la red de coexpresión de los módulos altamente relacionados en la última etapa. Además, en estos módulos, también notamos genes que fueron anotados como codificadores de poligalacturonasa y pectinesterasa, dos pectinasa que se esperaba que fueran actores principales en la separación celular durante la dehiscencia. qRT-PCR confirmó además los perfiles de expresión de estos factores relacionados con la modificación de la pared celular, que poseían una abundancia transcripcional especial alta en la etapa final. Estos resultados sugieren que la separación celular asociada a la pared celular, uno de los procesos esenciales posteriores a la dehiscencia del fruto, ocurrió en frutos en dehiscencia durante la maduración. Las hidrolasas que actúan sobre los componentes de la pared celular son buenos candidatos para mediar la señal de dehiscencia del fruto. En conclusión, nuestro análisis proporcionó información sobre la dehiscencia del fruto mediada por macromoléculas de la pared celular durante la maduración en .