La heterosis se refiere al fenómeno donde los híbridos exhiben un rendimiento superior en comparación con los fenotipos parentales y ha sido ampliamente utilizada en programas de cruce para animales y cultivos, sin embargo, los mecanismos moleculares subyacentes a este fenómeno siguen siendo enigmáticos. Una mejor comprensión de los patrones de expresión génica en pollos post-eclosión es muy importante para explorar la base genética subyacente a rasgos económicamente importantes en el cruce de pollos. En este estudio, se seleccionaron tejidos de músculo pectoral e hígado (n = 36) de aves F1 de hermanos completos y sus líneas parentales puras para identificar patrones de expresión génica y genes expresados diferencialmente (DEGs) a los 28 días de edad mediante secuenciación de ARN específica de cadena (ssRNA-seq). Este estudio indica que la aditividad es el patrón de expresión génica predominante en el músculo pectoral post-eclosión de los pollos F1 (80.6% de los genes con aditividad) y en el hígado (94.2% de los genes con aditividad). En el músculo pectoral, el análisis de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) reveló que un total de 11 términos de procesos biológicos (BP) estrechamente asociados con el crecimiento y desarrollo fueron anotados en los conjuntos de DEG identificados y conjuntos de genes no aditivos, incluyendo . La anotación de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) presentó que se identificaron un total de seis vías relacionadas con el crecimiento y desarrollo, involucrando genes clave como , , , , y , incluyendo la vía de señalización PPAR, la vía de señalización TGF-beta y la vía de señalización mTOR. Nuestros resultados pueden proporcionar una base teórica para el cruce en animales domésticos.