La relación entre las variaciones de secuencia génica relacionadas con el cadmio en el arroz y la acumulación de cadmio
Autores: Li, Weixing; Xu, Feng; Cai, Tingting; Zhao, Wanling; Lin, Jianting; Huang, Jiayu; Wang, Liguo; Bian, Jianmin; Fu, Junru; Ouyang, Linjuan; Cai, Yicong; He, Haohua; Sun, Xiaotang; Zhu, Changlan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La relación entre las variaciones de secuencia génica relacionadas con el cadmio en el arroz y la acumulación de cadmio
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Cd
Contaminación
Genes
Marcadores
Alelos
Acumulación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
La contaminación por cadmio (Cd) y la absorción en los granos de arroz en desarrollo representan una gran amenaza para la salud humana. Los estudios de genes específicos pueden ofrecer nuevas perspectivas sobre los roles funcionales de genes particulares, resaltando alelos candidatos que pueden ser utilizados como marcadores de ADN. En consecuencia, la identificación de nuevos rasgos relacionados con el Cd y variantes de secuencia puede proporcionar nuevos marcadores moleculares para la resistencia al Cd en el arroz. En el presente estudio, se realizó un análisis de diversidad genética en 85 variedades de arroz que mostraban una acumulación variada de Cd, y se detectaron 436 sitios polimórficos simples (SNP) correspondientes a 43 haplotipos en 12 genes asociados con el Cd. Al utilizar la información de los SNP, las 85 variedades de arroz se clasificaron en 2 grupos con diferentes categorías de origen y contenidos de Cd. Entre las variantes, 45 sitios en 5 genes estaban significativamente asociados con el contenido de Cd en los granos de arroz, de los cuales 8 alelos en genes específicos estaban correlacionados negativamente con la acumulación de Cd. Los resultados del análisis de agregación de haplotipos para ciertos genes mostraron que las 85 variedades de arroz se dividieron en 5 grupos. Interesantemente, la mayoría de las variedades en el Grupo A pertenecían al tipo tropical, que contenía la agregación de tres alelos favorables, mientras que las variedades templadas constituían la mayoría del Grupo B sin alelos favorables. Esta observación sugiere que la combinación alélica encontrada en las variedades de arroz tropicales puede ser prometedora para reducir los niveles de acumulación de Cd en los granos de arroz. Los alelos asociados con el Cd identificados en el presente estudio no solo pueden utilizarse para verificar la tolerancia al Cd de las variedades de arroz, sino también como marcadores moleculares funcionales para diferenciar la fuente de las variedades de arroz, lo que proporciona una mejor comprensión de la relación entre la variación de secuencia en genes relacionados con el Cd y la acumulación de Cd en el arroz.
Descripción
La contaminación por cadmio (Cd) y la absorción en los granos de arroz en desarrollo representan una gran amenaza para la salud humana. Los estudios de genes específicos pueden ofrecer nuevas perspectivas sobre los roles funcionales de genes particulares, resaltando alelos candidatos que pueden ser utilizados como marcadores de ADN. En consecuencia, la identificación de nuevos rasgos relacionados con el Cd y variantes de secuencia puede proporcionar nuevos marcadores moleculares para la resistencia al Cd en el arroz. En el presente estudio, se realizó un análisis de diversidad genética en 85 variedades de arroz que mostraban una acumulación variada de Cd, y se detectaron 436 sitios polimórficos simples (SNP) correspondientes a 43 haplotipos en 12 genes asociados con el Cd. Al utilizar la información de los SNP, las 85 variedades de arroz se clasificaron en 2 grupos con diferentes categorías de origen y contenidos de Cd. Entre las variantes, 45 sitios en 5 genes estaban significativamente asociados con el contenido de Cd en los granos de arroz, de los cuales 8 alelos en genes específicos estaban correlacionados negativamente con la acumulación de Cd. Los resultados del análisis de agregación de haplotipos para ciertos genes mostraron que las 85 variedades de arroz se dividieron en 5 grupos. Interesantemente, la mayoría de las variedades en el Grupo A pertenecían al tipo tropical, que contenía la agregación de tres alelos favorables, mientras que las variedades templadas constituían la mayoría del Grupo B sin alelos favorables. Esta observación sugiere que la combinación alélica encontrada en las variedades de arroz tropicales puede ser prometedora para reducir los niveles de acumulación de Cd en los granos de arroz. Los alelos asociados con el Cd identificados en el presente estudio no solo pueden utilizarse para verificar la tolerancia al Cd de las variedades de arroz, sino también como marcadores moleculares funcionales para diferenciar la fuente de las variedades de arroz, lo que proporciona una mejor comprensión de la relación entre la variación de secuencia en genes relacionados con el Cd y la acumulación de Cd en el arroz.