Los aleloquímicos fenólicos de los exudados radiculares dominan la formación de la rizosfera, conducen a la autotoxicidad en plantas sometidas a estrés por monocultivo continuo (CM) e inducen la aparición de enfermedades de replantación. Sin embargo, los mecanismos regulatorios que rigen el transporte de fenólicos desde las raíces de las plantas hacia la rizosfera siguen siendo poco comprendidos. Se ha caracterizado preliminarmente un posible transportador de eflujo fenólico, designado RgMATE35. El objetivo de este estudio fue elucidar la función molecular de RgMATE35 en la secreción de fenólicos e investigar su papel en el desarrollo de la enfermedad de replantación en plantas utilizando PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR), transformación genética, HPLC-Q-TOF-MS y otras técnicas analíticas. Un análisis del patrón de expresión de tejidos reveló que se expresa altamente en las raíces de las plantas. El análisis de expresión transitoria confirmó la localización de la proteína en las membranas plasmáticas. Una evaluación de la actividad de transporte de RgMATE35 indicó que desempeña un papel en facilitar el eflujo del ácido ferúlico etiquetado ([H]-FA) y del ácido trans--cumarínico [H]-CA. Los resultados de estudios funcionales demostraron que RgMATE35 media positivamente la secreción de FA y CA desde las raíces de las plantas hacia la rizosfera. Un análisis molecular y fisiológico de plantas transgénicas sometidas a estrés por CM reveló que la sobreexpresión o represión de resultó en cambios notables en el grado de daño autotóxico en las plantas. Estos hallazgos demuestran que RgMATE35 desempeña un papel positivo en el desarrollo de la enfermedad de replantación a través de la secreción de ácidos fenólicos desde las raíces de las plantas. También proporcionan un marco fundamental para elucidar el mecanismo regulador molecular a través del cual los MATEs regulan la enfermedad de replantación mediante la secreción radicular de aleloquímicos.