Las plantas están expuestas a una diversa gama de estresores bióticos, incluidos hongos, bacterias, nematodos, insectos y virus. Para combatir a estos enemigos, las plantas han desarrollado a lo largo del tiempo un arsenal de mecanismos de defensa, entre los cuales los metabolitos secundarios son los más efectivos. Además, para superar el impacto negativo de los pesticidas químicos, los metabolitos secundarios de las plantas pueden ser aprovechados para desarrollar nuevas estrategias de manejo de enfermedades. Los alcaloides, flavonoides, terpenos y aceites esenciales son las principales clases de metabolitos secundarios en respuesta a patógenos/plagas en las plantas. Entre estos, los saponinas han mostrado un potencial significativo para suprimir una amplia gama de patógenos de plantas. Sin embargo, aún no se han explorado a fondo en comparación con otros metabolitos secundarios en la defensa de las plantas, y por lo tanto, existe un bajo número de agentes de control de enfermedades en los mercados agrícolas basados en saponinas. Así, esta revisión tiene como objetivo rectificar este sesgo al identificar y reconocer la importancia de las saponinas como equivalentes a otras clases de metabolitos secundarios en los sistemas de defensa de las plantas. También proporciona la primera revisión holística sobre el papel de las saponinas con mecanismos conocidos contra todos los principales patógenos/plagas de plantas. Además, esta revisión discute el potencial de los cultivos ricos en saponinas para proporcionar productos de manejo de plagas/patógenos ecológicos para el manejo integrado de plagas (MIP) y perspectivas sobre el potencial de los derivados de saponinas en el desarrollo de biocidas novedosos para una agricultura sostenible.