La posible introducción del SARS-CoV-2, el virus responsable de la pandemia de COVID-19, en las poblaciones de murciélagos de América del Norte es de interés para los gestores de vida silvestre debido a los recientes declives mediado por enfermedades de varias especies. Las poblaciones de murciélagos marrones pequeños han colapsado debido al síndrome de la nariz blanca (WNS), una enfermedad causada por la introducción y propagación del patógeno fúngico. A lo largo de gran parte de los Estados Unidos y el sur de Canadá, grandes colonias de la especie establecieron rutinariamente refugios diurnos en estructuras antropogénicas, creando así el potencial para el contacto humano directo y la transmisión de enfermedades entre especies. Dado los recientes declives y el potencial de más impactos de enfermedades, recolectamos hisopos orales de ocho colonias de maternidad de murciélagos marrones pequeños para evaluar la presencia y prevalencia del SARS-CoV-2 mediante análisis de RT-qPCR. Las colonias de murciélagos marrones pequeños en Maryland, New Hampshire, Nueva Jersey, Nueva York, Rhode Island y Virginia fueron muestreadas durante mayo-agosto de 2022. De 235 individuos analizados, ningún murciélago dio positivo por SARS-CoV-2. Nuestros resultados indican que los murciélagos marrones pequeños pueden no contraer SARS-CoV-2 o que el virus persiste en niveles indetectables en las poblaciones del Atlántico Medio y el Noreste durante los meses de verano. No obstante, el monitoreo continuo y el trabajo futuro que aborde otras estaciones pueden ser necesarios para determinar de manera concluyente el estado de infección.