El propósito de este experimento fue investigar las diferencias en la morfología del tejido ruminal, el contenido de ácidos grasos volátiles y la microflora ruminal entre las ovejas de carne Tianhua y las ovejas de lana fina alpina de Gansu bajo las mismas condiciones de pastoreo. Se seleccionaron al azar doce corderos de 30 días de edad de dos rebaños diferentes en la aldea de Duolong y pastaron juntos durante un período de 150 días. El tejido ruminal se fijó con paraformaldehído al 4% y se llevó al laboratorio para la tinción H&E, el contenido de ácidos grasos volátiles de los contenidos ruminales se detectó mediante cromatografía de gases, y la estructura de la flora ruminal se secuenció mediante secuenciación de longitud completa del gen 16S rRNA bacteriano utilizando la plataforma de secuenciación PacBio. El contenido de ácido acético y el contenido total de ácidos de los contenidos ruminales de las ovejas de carne Tianhua fueron significativamente más altos que los de las ovejas de lana fina alpina de Gansu (< 0.05). La altura de las papilas ruminales de las ovejas de carne Tianhua fue significativamente mayor que la de las ovejas de lana fina alpina de Gansu (< 0.05). La diversidad y riqueza de la flora ruminal de las ovejas de carne Tianhua fueron mayores que las de las ovejas de lana fina alpina de Gansu, y el análisis Beta mostró que la estructura de la microflora de las dos ovejas de lana fina era significativamente diferente. A nivel de filo, Firmicutes y Bacteroidetes dominaron la flora ruminal de las ovejas de carne Tianhua y las ovejas de lana fina alpina de Gansu. A nivel de género, las cepas dominantes fueron y. El análisis LEfSe mostró que era una especie diferencial altamente abundante en las ovejas de carne Tianhua y lachnospiraccac era una especie diferencial altamente abundante en las ovejas de lana fina alpina de Gansu. Finalmente, tanto las bases de datos KEGG como COG mostraron que el enriquecimiento de las vías biometabólicas, como la replicación y reparación y la traducción, fue significativamente mayor en las ovejas de carne Tianhua que en las ovejas de lana fina alpina de Gansu (< 0.05). En general, hubo algunas similitudes entre las ovejas de carne Tianhua y las ovejas de lana fina alpina de Gansu en la morfología del tejido ruminal, la capacidad de fermentación ruminal y la estructura de la flora ruminal. Sin embargo, las ovejas de carne Tianhua tuvieron un mejor rendimiento en el contenido de ácido acético ruminal, la altura de las papilas ruminales y el contenido de bacterias beneficiosas. Estas diferencias pueden ser una de las razones por las cuales las ovejas de carne Tianhua son más adecuadas para crecer en áreas pastorales alpinas que las ovejas de lana fina alpina de Gansu.