Un método cuantitativo en tiempo real RT-PCR novedoso y altamente inclusivo para la detección amplia y eficiente del virus asociado al enrollamiento de la hoja de la vid 1
Autores: Morán, Félix; Olmos, Antonio; Glasa, Miroslav; Silva, Marilia Bueno Da; Maliogka, Varvara; Wetzel, Thierry; Ruiz-García, Ana Belén
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un método cuantitativo en tiempo real RT-PCR novedoso y altamente inclusivo para la detección amplia y eficiente del virus asociado al enrollamiento de la hoja de la vid 1
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Vid
GLRaV-1
Virus
Método de detección
RT-PCR en tiempo real
Material vegetal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La vid (L.) es uno de los cultivos más importantes del mundo debido a su impacto económico y social. Al igual que muchos otros cultivos, la vid es susceptible a diferentes tipos de enfermedades causadas por microorganismos patógenos. El virus asociado a la enfermedad de enrollamiento de la hoja de la vid 1 (GLRaV-1) es un virus asociado con la enfermedad de enrollamiento de la hoja de la vid y se considera a nivel nacional y europeo como un patógeno que debe estar ausente en material vegetal propagativo. Por esta razón, la disponibilidad de técnicas de detección específicas, sensibles y fiables para determinar el estado sanitario de las plantas es de gran importancia. El objetivo de esta investigación fue el desarrollo de un nuevo método de detección de GLRaV-1 basado en una RT-PCR cuantitativa en tiempo real TaqMan dirigida a la región del genoma de la proteína de la cápside e incluyendo un control interno del hospedador en una reacción duplex. Para ello, se recuperaron tres nuevos genomas completos de GLRaV-1 mediante HTS y se alinearon con todas las secuencias disponibles en las bases de datos. El método ha sido validado siguiendo los estándares de EPPO y se ha aplicado para el diagnóstico de material vegetal de campo y vectores de transmisión. El nuevo protocolo diseñado ha resultado ser altamente sensible así como mucho más específico que los métodos actualmente disponibles para la detección y cuantificación absoluta del título viral de GLRaV-1.
Descripción
La vid (L.) es uno de los cultivos más importantes del mundo debido a su impacto económico y social. Al igual que muchos otros cultivos, la vid es susceptible a diferentes tipos de enfermedades causadas por microorganismos patógenos. El virus asociado a la enfermedad de enrollamiento de la hoja de la vid 1 (GLRaV-1) es un virus asociado con la enfermedad de enrollamiento de la hoja de la vid y se considera a nivel nacional y europeo como un patógeno que debe estar ausente en material vegetal propagativo. Por esta razón, la disponibilidad de técnicas de detección específicas, sensibles y fiables para determinar el estado sanitario de las plantas es de gran importancia. El objetivo de esta investigación fue el desarrollo de un nuevo método de detección de GLRaV-1 basado en una RT-PCR cuantitativa en tiempo real TaqMan dirigida a la región del genoma de la proteína de la cápside e incluyendo un control interno del hospedador en una reacción duplex. Para ello, se recuperaron tres nuevos genomas completos de GLRaV-1 mediante HTS y se alinearon con todas las secuencias disponibles en las bases de datos. El método ha sido validado siguiendo los estándares de EPPO y se ha aplicado para el diagnóstico de material vegetal de campo y vectores de transmisión. El nuevo protocolo diseñado ha resultado ser altamente sensible así como mucho más específico que los métodos actualmente disponibles para la detección y cuantificación absoluta del título viral de GLRaV-1.