La alfalfa es una leguminosa forrajera herbácea perenne que se ve significativamente afectada de manera adversa por el monocultivo. La rotación de cultivos es la medida más efectiva para superar los obstáculos del cultivo continuo. Sin embargo, los mecanismos de cómo las comunidades bacterianas se ven afectadas y los posibles vínculos entre estos efectos y los sistemas de cultivo siguen siendo poco comprendidos.