El estrés por sequía es un fenómeno global anual que tiene efectos devastadores en la producción de cultivos, por lo que se han realizado numerosos estudios para mejorar la resistencia de los cultivos a la sequía. La microbiota asociada a las plantas juega un papel crucial en la salud y el crecimiento de los cultivos; sin embargo, tenemos un entendimiento limitado de los procesos clave involucrados en la adaptación de los cultivos inducida por el microbioma al estrés por sequía. En esta revisión, resumimos los efectos adversos del estrés por sequía en el crecimiento de los cultivos en términos de germinación, fotosíntesis, absorción de nutrientes, biomasa y rendimiento, con un enfoque en la respuesta de las comunidades microbianas del suelo al estrés por sequía y las interacciones planta-microbio bajo estrés por sequía. Además, revisamos los mecanismos morfo-fisiológicos, bioquímicos y moleculares que subyacen al efecto mitigador de los microbios sobre el estrés por sequía en los cultivos. Finalmente, destacamos las direcciones futuras de investigación, incluyendo la caracterización de especies específicas del microbioma de la rizosfera con exudados radiculares correspondientes y la eficiencia de los inoculantes de rizobacterias en condiciones de sequía. Tal investigación avanzará nuestra comprensión de las complejas interacciones entre cultivos y microbios y mejorará la resistencia de los cultivos al estrés por sequía a través de la aplicación de microbios beneficiosos adaptativos a la sequía.