Rol de los Contaminantes Orgánicos Persistentes en la Progresión del Cáncer de Mama e Identificación de Inhibidores del Receptor de Estrógeno Alfa Utilizando Enfoques de Minería In-Silico y Redes de Interacción Droga-Droga
Autores: Zainab, Bibi; Ayaz, Zainab; Rashid, Umer; Al Farraj, Dunia A.; Alkufeidy, Roua M.; AlQahtany, Fatmah S.; Aljowaie, Reem M.; Abbasi, Arshad Mehmood
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Rol de los Contaminantes Orgánicos Persistentes en la Progresión del Cáncer de Mama e Identificación de Inhibidores del Receptor de Estrógeno Alfa Utilizando Enfoques de Minería In-Silico y Redes de Interacción Droga-Droga
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Asociación
POPs
Cáncer de mama
ERalpha
Compuestos naturales
Compuestos sintéticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
La fuerte asociación entre los contaminantes orgánicos persistentes (COP) y el cáncer de mama en humanos ha sido sugerida en varios estudios epidemiológicos. Sin embargo, la interacción de los COP con la proteína ERalpha del cáncer de mama y la identificación de compuestos naturales y sintéticos para inhibir esta interacción sigue siendo un misterio. En consecuencia, el presente estudio tuvo como objetivo explorar la interacción entre los COP y ERalpha utilizando la herramienta de entorno operativo molecular (MOE) e identificar compuestos naturales y sintéticos para inhibir esta asociación a través de un enfoque basado en clústeres. Para validar si nuestro enfoque podría distinguir entre compuestos activos e inactivos, se realizó una pantalla virtual (VS) utilizando activos (627 compuestos) como control positivo y decoys (20,818 compuestos) como un conjunto de datos negativo obtenido de DUD-E. Comparativamente, los parafinas cloradas de cadena corta (SCCPs), el hexabromociclododecano (HBCD) y el fluoruro de perfluorooctanosulfonilo (PFOSF) mostraron interacciones fuertes con la proteína ERalpha basadas en los valores de puntuación más bajos de -31.946, -18.916, -17.581 kcal/mol, respectivamente. De 7856 compuestos naturales y sintéticos recuperados, se seleccionaron sesenta en base a la modularidad y posteriormente se acoplaron con ERalpha. Basado en los valores de puntuación más bajos, ZINC08441573, ZINC00664754, ZINC00702695, ZINC00627464 y ZINC08440501 (compuestos sintéticos), y capsaicina, flavopiridol, tectorgenina y ácido elágico (compuestos naturales) mostraron interacciones increíbles con los sitios activos de ERalpha, incluso más convincentes y resistentes que los medicamentos estándar para el cáncer de mama Tamoxifeno, Arimidex y Letrozole. Nuestros hallazgos confirman el papel de los COP en la progresión del cáncer de mama y sugieren que los compuestos naturales y sintéticos con alta afinidad de unión podrían ser candidatos más eficientes y apropiados para tratar el cáncer de mama después de la validación a través de estudios in vitro e in vivo.
Descripción
La fuerte asociación entre los contaminantes orgánicos persistentes (COP) y el cáncer de mama en humanos ha sido sugerida en varios estudios epidemiológicos. Sin embargo, la interacción de los COP con la proteína ERalpha del cáncer de mama y la identificación de compuestos naturales y sintéticos para inhibir esta interacción sigue siendo un misterio. En consecuencia, el presente estudio tuvo como objetivo explorar la interacción entre los COP y ERalpha utilizando la herramienta de entorno operativo molecular (MOE) e identificar compuestos naturales y sintéticos para inhibir esta asociación a través de un enfoque basado en clústeres. Para validar si nuestro enfoque podría distinguir entre compuestos activos e inactivos, se realizó una pantalla virtual (VS) utilizando activos (627 compuestos) como control positivo y decoys (20,818 compuestos) como un conjunto de datos negativo obtenido de DUD-E. Comparativamente, los parafinas cloradas de cadena corta (SCCPs), el hexabromociclododecano (HBCD) y el fluoruro de perfluorooctanosulfonilo (PFOSF) mostraron interacciones fuertes con la proteína ERalpha basadas en los valores de puntuación más bajos de -31.946, -18.916, -17.581 kcal/mol, respectivamente. De 7856 compuestos naturales y sintéticos recuperados, se seleccionaron sesenta en base a la modularidad y posteriormente se acoplaron con ERalpha. Basado en los valores de puntuación más bajos, ZINC08441573, ZINC00664754, ZINC00702695, ZINC00627464 y ZINC08440501 (compuestos sintéticos), y capsaicina, flavopiridol, tectorgenina y ácido elágico (compuestos naturales) mostraron interacciones increíbles con los sitios activos de ERalpha, incluso más convincentes y resistentes que los medicamentos estándar para el cáncer de mama Tamoxifeno, Arimidex y Letrozole. Nuestros hallazgos confirman el papel de los COP en la progresión del cáncer de mama y sugieren que los compuestos naturales y sintéticos con alta afinidad de unión podrían ser candidatos más eficientes y apropiados para tratar el cáncer de mama después de la validación a través de estudios in vitro e in vivo.