El ácido poliaspártico (PASP), un sinérgico de fertilizante biodegradable y ecológico que muestra potencial para mejorar la eficiencia en el uso de nutrientes en sistemas agrícolas, tiene su papel integrador con microorganismos de la rizosfera aún insuficientemente explorado. Este estudio integró experimentos en macetas al aire libre, análisis bioquímicos del suelo y secuenciación del microbioma para investigar los efectos de la co-aplicación de PASP y la rizobacteria promotora del crecimiento vegetal (PGPR) S13 en el crecimiento de la papa, con cuatro tratamientos establecidos que incluyen control en blanco (CK), aplicación única de PASP (S0P1), inoculación única de PGPR (S1P0) y co-aplicación de PASP y PGPR (S1P1), y 25 macetas por tratamiento como réplicas. Los resultados mostraron que, en comparación con el tratamiento S0P1, el tratamiento S1P1 aumentó significativamente la altura de la planta (9.59%), el diámetro del tallo (28.39%), la longitud de la raíz (38.61%), así como la biomasa de raíces y brotes (21.26% y 25.17%, respectivamente) (ANOVA, prueba de Duncan, < 0.05). También mejoró el nitrógeno amoniacal (40.00%), el nitrógeno nitrato (57.70%), el potasio disponible (47.56%) y la actividad de ureasa en el suelo de la rizosfera (ANOVA, prueba de Duncan, < 0.05). La secuenciación de 16S rRNA reveló que el tratamiento S1P1 enriqueció taxones beneficiosos, mientras que suprimió géneros competitivos. El análisis de redundancia (RDA) indicó que el potasio disponible y el nitrógeno amoniacal fueron los factores clave que moldearon la estructura de la comunidad microbiana. En conclusión, combinar PASP con PGPR mejora sinérgicamente la disponibilidad de nutrientes en el suelo y reconfigura el microbioma de la rizosfera, resultando en un crecimiento mejorado de la papa, demostrando así su potencial como un bioestimulante de doble función para sistemas de producción de papa ecológicos y sostenibles.