La rizosfera alberga abundantes rizobacterias promotoras del crecimiento de las plantas (PGPR) que son vitales para la salud de las plantas. En este estudio, seleccionamos bacterias promotoras del crecimiento del suelo de la rizosfera del tomate, verificamos sus funciones y construimos la combinación óptima de bacterias promotoras del crecimiento para promover el crecimiento del tomate. Además, se evaluaron los efectos de estas bacterias en varios parámetros fisiológicos y bioquímicos de las plantas de tomate. Se aislaron un total de 36 cepas de rizobacterias del suelo de la rizosfera del tomate y se evaluaron sus capacidades para producir ácido indol-3-acético (IAA), solubilizar fosfatos y transportadores de hierro. Las cepas bacterianas con las mayores capacidades de producción de IAA (R62, R317), solubilización de fosfatos (R41, R219) y producción de sideróforos (R25, R325) fueron seleccionadas para formar tres combinaciones bacterianas: R62 + R219 + R317 + R325 (T1), R62 + R325 (T5) y R317 + R325 (T8). Quince días después de la inoculación, las tres combinaciones mostraron un efecto estimulante en el crecimiento de plántulas en comparación con el control no inoculado. La inoculación con T1, T5 y T8 aumentó el índice de vigor de las plántulas en un 173.7%, 204.1% y 168.7%, respectivamente. En comparación con el control no inoculado, la combinación T1 aumentó las actividades de la polifenol oxidasa, peroxidasa y la tasa fotosintética neta en un 132.7%, 18.7%, 58.5%, y reguló al alza los niveles de expresión relativa de los genes relacionados con la asimilación fotosintética en 22.2-, 6.6-, 1.95- y 2.0 veces, respectivamente. Nuestros hallazgos proporcionan un potencial para construir combinaciones rizobacterianas de diferentes grupos funcionales para mejorar el crecimiento de los cultivos.