En las últimas décadas, la industria avícola ha asumido un papel fundamental en la satisfacción de la demanda global de proteínas animales asequibles. Si bien la avicultura contribuye de manera sustancial a la seguridad alimentaria y la nutrición, también presenta desafíos ambientales y de salud pública. El uso de estiércol avícola como fertilizante para los suelos agrícolas plantea preocupaciones sobre la transferencia de patógenos y microorganismos resistentes a los medicamentos de las granjas avícolas a las áreas de producción de cultivos. Por otro lado, según la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO), los fungicidas representan el segundo grupo químico más utilizado en las prácticas agrícolas. En este contexto, los suelos agrícolas reciben la aplicación tanto de estiércol avícola como fertilizante como de fungicidas utilizados en la producción agrícola. Esta práctica puede resultar en contaminación fúngica del suelo y el desarrollo de resistencia a los antifúngicos. Este artículo explora la necesidad de monitorear la resistencia a los antifúngicos, particularmente en áreas de producción de alimentos con co-aplicación de estiércol avícola y fungicidas. También destaca el papel de los hongos en los ecosistemas, la descomposición y las asociaciones mutualistas de plantas. Hacemos un llamado a la investigación interdisciplinaria para comprender de manera integral la resistencia fúngica a los fungicidas en el medio ambiente. Este enfoque busca promover la sostenibilidad en los ámbitos de la salud humana, la agricultura y el medio ambiente, alineándose perfectamente con el concepto de Una Salud.