Para programas de conservación y cría efectivos, investigar la diversidad genética de los caballos es esencial. Este estudio revisa 76 investigaciones publicadas desde 2012 sobre el análisis de ADN mitocondrial (ADNmt), con un enfoque en las líneas maternas y los haplogrupos. Los hallazgos destacan desafíos persistentes, particularmente la necesidad de actualizar el sistema de clasificación de haplogrupos de 2012 y mitigar la pérdida de datos causada por el recorte de secuencias. Una comprensión más completa de la diversidad genética equina requiere abordar razas y regiones subrepresentadas, que siguen siendo pasadas por alto en los estudios existentes. Además, integrar los hallazgos de ADNmt con rasgos de rendimiento y secuenciación de genoma completo mejoraría la evaluación genética, proporcionando información valiosa para la conservación y gestión. En última instancia, estos avances son cruciales para garantizar la preservación sostenible de las poblaciones de caballos en todo el mundo.