Las pruebas moleculares genéticas están comenzando a ganar terreno como parte de la práctica clínica estándar para perros con cáncer debido a sus múltiples beneficios, como la posibilidad de proporcionar información diagnóstica, pronóstica y/o terapéutica. Sin embargo, los beneficios y el éxito final del análisis genómico en el entorno clínico dependen de la solidez de las herramientas utilizadas para generar los resultados, que continúan expandiéndose a medida que se desarrollan nuevas tecnologías. Con este fin, revisamos los diferentes materiales de los cuales se pueden aislar células tumorales, ADN, ARN y las proteínas relevantes, así como los métodos disponibles para interrogar su perfil molecular, incluyendo el análisis de las alteraciones genéticas (tanto somáticas como germinales), cambios transcripcionales y modificaciones epigenéticas (incluyendo la metilación/acetilación del ADN y microARNs). También miramos hacia el futuro y las herramientas que se están desarrollando actualmente, como el uso de inteligencia artificial (IA) para identificar mutaciones genéticas a partir de criterios histomorfológicos. En resumen, encontramos que la caracterización genética molecular de las neoplasias caninas ha tenido un comienzo prometedor. A medida que comprendamos más sobre la genética subyacente a estos tumores y se disponga de terapias más específicas, sin duda se convertirá en un pilar en la prestación de atención veterinaria de precisión para perros con cáncer.