Mecanismo de Defensa Adaptativa Durante el Período de Floración Revelado por Análisis Transcriptómico Comparativo
Autores: Liu, Weiwei; Yu, Chenghua; Yang, Kaiye; Wang, Ling; Gao, Lianming; Mo, Xinchun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Mecanismo de Defensa Adaptativa Durante el Período de Floración Revelado por Análisis Transcriptómico Comparativo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Especies ampliamente distribuidas
Suroeste de China
Valor ornamental
Recurso culinario
Mecanismos de defensa
Adaptaciones ecológicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
una especie ampliamente distribuida en el suroeste de China, es reconocida no solo por su significativo valor ornamental, sino también como un recurso culinario para las tribus locales. Sin embargo, los mecanismos de defensa subyacentes a las adaptaciones ecológicas de siguen sin ser elucidado. En este estudio, realizamos análisis transcriptómicos comparativos de varios órganos (corola, androceo/gineceo y hojas) de recolectados de dos regiones distintas. Se generaron aproximadamente 186.98 Gb de datos limpios de tres órganos a través de estas regiones. A través de la ensamblaje de novo, se obtuvieron un total de 92,025 unigenes y casi la mitad de ellos (43,515 unigenes) fueron anotados con éxito. El análisis de enriquecimiento de genes diferencialmente expresados (DEGs) dentro de tres grupos comparativos de diferentes órganos (HQI/LFI, HQO/LFO y HQL/LFL, respectivamente) reveló que la distribución en la región de Heqing mostró una mayor necesidad de inmunidad vegetal, incluyendo resistencia a enfermedades, insectos y herbívoros en varios órganos de la planta. Por el contrario, en la región de Lijiang mostró una mayor dependencia de factores ambientales, como la tolerancia al frío, la producción de compuestos aromáticos y la atracción de insectos polinizadores. Notablemente, la validación de 21 genes clave identificados de vías de enriquecimiento reguladas significativamente a través de diferentes órganos mostró consistencia funcional en el análisis de enriquecimiento KEGG entre diferentes órganos en estas dos regiones. Las disparidades funcionales observadas en el transcriptoma a través de distintas regiones proporcionan una valiosa perspectiva para entender su mecanismo de defensa adaptativa.
Descripción
una especie ampliamente distribuida en el suroeste de China, es reconocida no solo por su significativo valor ornamental, sino también como un recurso culinario para las tribus locales. Sin embargo, los mecanismos de defensa subyacentes a las adaptaciones ecológicas de siguen sin ser elucidado. En este estudio, realizamos análisis transcriptómicos comparativos de varios órganos (corola, androceo/gineceo y hojas) de recolectados de dos regiones distintas. Se generaron aproximadamente 186.98 Gb de datos limpios de tres órganos a través de estas regiones. A través de la ensamblaje de novo, se obtuvieron un total de 92,025 unigenes y casi la mitad de ellos (43,515 unigenes) fueron anotados con éxito. El análisis de enriquecimiento de genes diferencialmente expresados (DEGs) dentro de tres grupos comparativos de diferentes órganos (HQI/LFI, HQO/LFO y HQL/LFL, respectivamente) reveló que la distribución en la región de Heqing mostró una mayor necesidad de inmunidad vegetal, incluyendo resistencia a enfermedades, insectos y herbívoros en varios órganos de la planta. Por el contrario, en la región de Lijiang mostró una mayor dependencia de factores ambientales, como la tolerancia al frío, la producción de compuestos aromáticos y la atracción de insectos polinizadores. Notablemente, la validación de 21 genes clave identificados de vías de enriquecimiento reguladas significativamente a través de diferentes órganos mostró consistencia funcional en el análisis de enriquecimiento KEGG entre diferentes órganos en estas dos regiones. Las disparidades funcionales observadas en el transcriptoma a través de distintas regiones proporcionan una valiosa perspectiva para entender su mecanismo de defensa adaptativa.