Aunque la industria de las papas fritas está en auge y se han lanzado clones distintos de procesamiento de papas fritas en los últimos 60 años, la arquitectura genética de sus características de procesamiento de papas fritas sigue siendo en gran parte desconocida. Los estudios de asociación del genoma a nivel mundial (GWAS) de casos y controles con datos de matrices de SNP de SolCAP para clones de procesamiento de papas fritas frente a todas las demás clases de mercado en el panel de diversidad de papas de 393 líneas se realizaron utilizando el paquete R GWASpoly, lo que permitió la detección de señales significativas en el cromosoma 10. Nuestros resultados se replicaron utilizando una replicación interna de un panel de 190 líneas corregido por estratos. Además, los análisis genómicos que emplean enfoques de barrido selectivo como el método de razón de verosimilitud compuesta entre poblaciones cruzadas (XP-CLR) y PCAdapt volvieron a detectar las mismas señales que las de nuestro GWAS. A través de la aplicación de cuatro enfoques de barrido selectivo, se encontraron diversas variantes genéticas en todo el genoma que habían sido seleccionadas diferencialmente. Estas regiones genómicas bajo selección junto con el análisis de datos transcriptómicos están involucradas en genes o loci relacionados con el metabolismo de carbohidratos y factores de transcripción, lo que indica que están asociados con la mejora del rendimiento de procesamiento de papas fritas de los cultivares de papa. Se diseñaron ensayos de PCR de alelos específicos competitivos (KASP) para los SNP causales para su uso en la validación de los clones de procesamiento de papas fritas. Los resultados podrían tener implicaciones para la cría asistida por genómica de los prometedores cultivares de procesamiento de papas fritas en papa.