El gen de resistencia a la roya del tallo efectivo contra Ug99 se mapeó en el cromosoma 2A basado en su enlace de repulsión en una población de líneas recombinantes endogámicas (RIL) Arina/Forno. Los intentos de identificar marcadores estrechamente vinculados utilizando los recursos genómicos disponibles fueron infructuosos. Este estudio utilizó una población RIL F Arina/Cezanne para identificar marcadores estrechamente vinculados. Usando el mapa DArTseq de Arina/Cezanne, se mapeó en el brazo corto del cromosoma 2D y co-segregó con 12 marcadores. Estas secuencias de marcadores DArTseq se utilizaron para una búsqueda BlastN para identificar contigs de secuencia de encuesta del cromosoma de trigo (CSS) correspondientes, y se desarrollaron marcadores basados en PCR. Se derivaron dos marcadores de repeticiones de secuencia simple (SSR), y, y dos marcadores de PCR específica de alelos competitivos (KASP) del contig 2DS_5324961 que se mapeó distalmente a. El análisis cito genético molecular utilizando hibridación fluorescente in situ (FISH) y hibridación genómica in situ (GISH) identificó una translocación terminal del cromosoma 2A en el cromosoma 2DL de Forno. Esta translocación habría llevado a la formación de un cuadrivalente que involucra los cromosomas 2A y 2D en la población Arina/Forno, que habría exhibido pseudo-vínculo entre y en el cromosoma 2AL. El polimorfismo del marcador más cercano entre un conjunto de 178 genotipos de trigo sugirió que este marcador puede ser utilizado para la selección asistida por marcadores de.