y, Dos Grupos de Retrotransposones LTR No Autónomos, Representan un Nuevo Tipo de Elementos Móviles Derivados de Genes de ARN Pequeño
Autores: Kojima, Kenji K.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
y, Dos Grupos de Retrotransposones LTR No Autónomos, Representan un Nuevo Tipo de Elementos Móviles Derivados de Genes de ARN Pequeño
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Retrotransposones
TRIMs
LTRs
Secuencia derivada de rRNA 5S
TSDs
ARN polimerasa III
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
Los retrotransposones terminales de repeticiones en miniatura (TRIMs) son retrotransposones cortos no autónomos de repeticiones terminales largas (LTR) que se encuentran en varios eucariotas. es una línea única de TRIM que contiene una secuencia derivada de 5S rRNA en sus LTRs. Aquí, se informan dos nuevos grupos de TRIMs, designados y, basados en análisis bioinformáticos y el uso de Repbase. se encuentra en hongos, animales y plantas, y sus LTRs contienen una secuencia similar a tRNA. Incluye dos LTRs y entre ellos existen un sitio de unión de iniciador (PBS) y un tracto polipurina (PPT). Los hongos y las plantas generan duplicaciones del sitio objetivo (TSDs) de 5 bp al integrarse, mientras que los animales generan TSDs de 4 bp. incluye una secuencia derivada de 5S rRNA en su LTR y se encuentra en dos genomas de nemertinos. genera TSDs de 5 bp al integrarse. Estos resultados sugieren que a pesar de sus promotores únicos, y son TRIMs cuya transposición depende de un retrotransposón LTR autónomo. Estos TRIMs pueden originarse a través de una inserción de SINE en un LTR de TRIM. El descubrimiento de y sugiere la presencia de TRIMs con un promotor para la ARN polimerasa III derivado de un gen de pequeño RNA, que aquí se denomina colectivamente TRIMp3.
Descripción
Los retrotransposones terminales de repeticiones en miniatura (TRIMs) son retrotransposones cortos no autónomos de repeticiones terminales largas (LTR) que se encuentran en varios eucariotas. es una línea única de TRIM que contiene una secuencia derivada de 5S rRNA en sus LTRs. Aquí, se informan dos nuevos grupos de TRIMs, designados y, basados en análisis bioinformáticos y el uso de Repbase. se encuentra en hongos, animales y plantas, y sus LTRs contienen una secuencia similar a tRNA. Incluye dos LTRs y entre ellos existen un sitio de unión de iniciador (PBS) y un tracto polipurina (PPT). Los hongos y las plantas generan duplicaciones del sitio objetivo (TSDs) de 5 bp al integrarse, mientras que los animales generan TSDs de 4 bp. incluye una secuencia derivada de 5S rRNA en su LTR y se encuentra en dos genomas de nemertinos. genera TSDs de 5 bp al integrarse. Estos resultados sugieren que a pesar de sus promotores únicos, y son TRIMs cuya transposición depende de un retrotransposón LTR autónomo. Estos TRIMs pueden originarse a través de una inserción de SINE en un LTR de TRIM. El descubrimiento de y sugiere la presencia de TRIMs con un promotor para la ARN polimerasa III derivado de un gen de pequeño RNA, que aquí se denomina colectivamente TRIMp3.