La inserción de un retrotransposón de 643 pb aguas arriba del CDS está asociada con la grasa dorsal de los cerdos de raza Large White
Autores: He, Jia; Yu, Miao; Chi, Chenglin; Du, Zhanyu; Zheng, Yao; Chen, Cai; Moawad, Ali Shoaib; Song, Chengyi; Wang, Xiaoyan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La inserción de un retrotransposón de 643 pb aguas arriba del CDS está asociada con la grasa dorsal de los cerdos de raza Large White
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Reguladores
ácido graso
Metabolismo de lípidos
Polimorfismos de inserción de retrotransposones
Genes
Grosor de la grasa dorsal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
son reguladores esenciales del metabolismo de ácidos grasos y lípidos en mamíferos. Aunque se han investigado los efectos de las variaciones genéticas, incluidos los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en los genes sobre el fenotipo de los animales domésticos, hay información limitada sobre el impacto de los polimorfismos de inserción de retrotransposones (RIPs). En este estudio, se utilizó un análisis comparativo del genoma combinado con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para excavar los RIPs en porcinos. También investigamos los posibles efectos de la inserción de retrotransposones en los patrones fenotípicos y de expresión. Este estudio identificó dos RIPs en genes, a saber, un ERV en el intrón 1 de y un retrotransposón combinado en el intrón 2 de , designados como -ERV-RIP y -COM-RIP, respectivamente. Estos RIPs exhibieron diferentes patrones de distribución entre razas indígenas chinas y razas comerciales occidentales. Los individuos con el genotipo -ERV-RIP (+/+ indicado como homocigoto con inserción) entre los cerdos Large White tenían un grosor de grasa dorsal corregido significativamente mayor (< 0.05) en comparación con aquellos con los otros dos genotipos. De manera similar, aquellos con el genotipo -COM-RIP tenían un grosor de grasa dorsal corregido significativamente mayor (< 0.05) que aquellos con los otros dos genotipos en cerdos Large White. Además, en lechones Sujiang de 30 días, la expresión génica en la grasa dorsal de aquellos con el genotipo -COM-RIP (-/- indicado como homocigoto sin inserción) fue significativamente mayor (< 0.01) que la de aquellos con otros genotipos. El ensayo de genes reporteros de luciferasa dual demostró que la inserción de retrotransposón combinada redujo significativamente la actividad del promotor de MYC en células C2C12 y 3T3-L1 (< 0.01). Por lo tanto, la inserción de retrotransposón combinada podría funcionar como un represor para disminuir la expresión de , haciendo de -COM-RIP un marcador molecular valioso para la selección asistida del grosor de grasa dorsal en la cría de cerdos.
Descripción
son reguladores esenciales del metabolismo de ácidos grasos y lípidos en mamíferos. Aunque se han investigado los efectos de las variaciones genéticas, incluidos los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en los genes sobre el fenotipo de los animales domésticos, hay información limitada sobre el impacto de los polimorfismos de inserción de retrotransposones (RIPs). En este estudio, se utilizó un análisis comparativo del genoma combinado con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para excavar los RIPs en porcinos. También investigamos los posibles efectos de la inserción de retrotransposones en los patrones fenotípicos y de expresión. Este estudio identificó dos RIPs en genes, a saber, un ERV en el intrón 1 de y un retrotransposón combinado en el intrón 2 de , designados como -ERV-RIP y -COM-RIP, respectivamente. Estos RIPs exhibieron diferentes patrones de distribución entre razas indígenas chinas y razas comerciales occidentales. Los individuos con el genotipo -ERV-RIP (+/+ indicado como homocigoto con inserción) entre los cerdos Large White tenían un grosor de grasa dorsal corregido significativamente mayor (< 0.05) en comparación con aquellos con los otros dos genotipos. De manera similar, aquellos con el genotipo -COM-RIP tenían un grosor de grasa dorsal corregido significativamente mayor (< 0.05) que aquellos con los otros dos genotipos en cerdos Large White. Además, en lechones Sujiang de 30 días, la expresión génica en la grasa dorsal de aquellos con el genotipo -COM-RIP (-/- indicado como homocigoto sin inserción) fue significativamente mayor (< 0.01) que la de aquellos con otros genotipos. El ensayo de genes reporteros de luciferasa dual demostró que la inserción de retrotransposón combinada redujo significativamente la actividad del promotor de MYC en células C2C12 y 3T3-L1 (< 0.01). Por lo tanto, la inserción de retrotransposón combinada podría funcionar como un represor para disminuir la expresión de , haciendo de -COM-RIP un marcador molecular valioso para la selección asistida del grosor de grasa dorsal en la cría de cerdos.