La cosecha de retención variable (CRV) fue diseñada para fines madereros y conservación de la biodiversidad en bosques naturales. Este sistema fue probado a nivel mundial, pero pocos estudios están relacionados con los componentes microbianos del suelo. El objetivo fue evaluar diferentes tipos de retención (retención agregada y dispersa) considerando diferentes años después de la cosecha (6, 9, 16 AHC) sobre los atributos de la comunidad microbiana del suelo en comparación con bosques primarios no gestionados (BP) en bosques de Nothofagus pumilio en Tierra del Fuego (Argentina). Este estudio también evaluó la influencia del clima, el suelo y la vegetación del sotobosque. Los resultados mostraron que la retención agregada aumentó el carbono de biomasa microbiana (CBM), el nitrógeno de biomasa microbiana (NBM) y la respiración basal del suelo (RBS) en comparación con la retención dispersa, pero con valores similares a los de BP. Sin embargo, las áreas cosechadas disminuyeron los valores de CBM/NBM en comparación con BP. Los resultados mostraron una disminución general en la biomasa microbiana y la actividad en los rodales de 9 AHC, con una recuperación positiva a los 16 AHC. El pH del suelo, la temperatura media anual y la cobertura de la vegetación del sotobosque mostraron una relación positiva con CBM, NBM y RBS. La recuperación después de 16 AHC alcanzó diferentes comunidades microbianas. Por lo tanto, se necesita el mantenimiento de los componentes de retención en los rodales gestionados durante períodos más largos. Los resultados destacan algunas ventajas de la CRV como herramienta para la conservación de microorganismos del suelo que habitan en los bosques, incluyendo la biomasa y la actividad microbiana.