La capacidad de las plantas para generar nuevos órganos y tejidos a lo largo de su ciclo de vida depende de la actividad de las células madre contenidas en los tejidos meristemáticos. Las células madre de las plantas están organizadas en pequeñas poblaciones agrupadas conocidas como nichos de células madre. Además de generar nuevas células indiferenciadas, los nichos de células madre también proporcionan la información posicional que mantiene las propiedades de autorrenovación de las células madre y controla la diferenciación no autónoma de los tejidos circundantes. En esta revisión, nuestro objetivo es analizar y discutir la literatura más reciente que describe el mecanismo molecular que controla la actividad y la organización del nicho de células madre en la raíz de la planta modelo (L.) Heynh. En particular, nos centraremos en las complejas redes regulatorias moleculares que controlan el equilibrio entre la condición de célula madre y la diferenciación en las células madre distales, así como el mantenimiento del estado mitóticamente inactivo del centro de quiescencia.