El sistema inmunológico innato (IIS) es un mecanismo de defensa antiguo y esencial que protege a los animales contra una amplia gama de patógenos y enfermedades. Aunque se ha estudiado extensamente en mamíferos, nuestra comprensión del IIS en otros taxones sigue siendo limitada. El pez cebra sirve como un modelo prometedor para investigar procesos relacionados con el IIS, sin embargo, la inmunogenética de los peces no está completamente elucidada. Para abordar esta brecha, realizamos un meta-análisis de conjuntos de datos de secuenciación de ARN de una sola célula (scRNA-seq) de la médula renal del pez cebra, abarcando aproximadamente 250,000 células inmunitarias. Nuestro análisis confirma la presencia de vías genéticas clave en las células inmunitarias innatas del pez cebra que son similares a las identificadas en mamíferos. Los macrófagos del pez cebra expresan específicamente genes que codifican catepsinas, proteínas del complejo mayor de histocompatibilidad de clase II, proteínas de membrana integral y el complejo V-ATPasa, y demuestran el enriquecimiento de procesos de ferroptosis de fosforilación oxidativa. Los neutrófilos se caracterizan por la expresión significativa de genes que codifican actinas, proteínas organizadoras del citoesqueleto, el complejo Arp2/3 y enzimas de glucólisis, y han demostrado su participación en las vías de señalización de GnRH y CLR, adherentes y uniones estrechas. Tanto los macrófagos como los neutrófilos expresan en gran medida genes de receptores tipo NOD, fagosomas y vías de lisosomas, así como genes involucrados en la apoptosis. Nuestros hallazgos refuerzan la idea sobre la existencia de un amplio espectro de fenotipos de células inmunitarias en peces, ya que encontramos solo un pequeño número de células con firmas pro- o antiinflamatorias claras.