La hemodinámica es el tema eterno del sistema circulatorio. La hemodinámica anormal y el desarrollo cardíaco y pulmonar se entrelazan para formar las características más importantes de los niños con enfermedades cardíacas congénitas (ECC), determinando así la calidad de vida a largo plazo de estos niños. Aquí, revisamos las variedades de anormalidades hemodinámicas que existen en niños con ECC, los modelos de roedores neonatales de ECC recientemente desarrollados y las inspiraciones que estos modelos nos han brindado en las áreas de proliferación y maduración de cardiomiocitos, así como en el desarrollo alveolar. Además, se destacan las limitaciones actuales, las direcciones futuras y la toma de decisiones clínicas basadas en estas inspiraciones. Comprender cómo los escenarios hemodinámicos asociados a ECC moldean el desarrollo cardíaco y pulmonar postnatal puede proporcionar un camino novedoso para mejorar la calidad de vida a largo plazo de los niños con ECC, el trasplante de cardiomiocitos derivados de células madre y la regeneración cardíaca.