La transcriptómica de célula única integrativa y el modelado de redes revelan reguladores modulares de la activación del genoma cigótico en ovejas
Autores: Li, Xiaopeng; Niu, Peng; Hu, Kai; Wang, Xueyan; Huang, Fei; Song, Pengyan; Gao, Qinghua; Fang, Di
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
La transcriptómica de célula única integrativa y el modelado de redes revelan reguladores modulares de la activación del genoma cigótico en ovejas
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Activación del genoma cigótico
Smart-seq2
Secuenciación de ARN de célula única
Embriones de oveja
Expresión diferencial
WGCNA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
La activación del genoma cigótico (ZGA) marca el cambio de los transcritos maternos a la transcripción embrionaria y es esencial para el desarrollo temprano. Aquí, aplicamos Smart-seq2 RNA-seq de una sola célula a embriones ovinos de 8, 16 y 32 células (in vivo e in vitro) y luego combinamos la expresión diferencial (|logFC| > 1, .adj < 0.05), WGCNA y la detección de comunidades de Louvain para revelar dos módulos regulatorios: uno centrado en el transporte de vesículas ER-Golgi/dinámica citoesquelética, y otro en la transición G2/M/esplicing de ARN. Nuestros hallazgos delinean un marco modular de ZGA ovina y sugieren objetivos para mejorar la eficiencia reproductiva.
Descripción
La activación del genoma cigótico (ZGA) marca el cambio de los transcritos maternos a la transcripción embrionaria y es esencial para el desarrollo temprano. Aquí, aplicamos Smart-seq2 RNA-seq de una sola célula a embriones ovinos de 8, 16 y 32 células (in vivo e in vitro) y luego combinamos la expresión diferencial (|logFC| > 1, .adj < 0.05), WGCNA y la detección de comunidades de Louvain para revelar dos módulos regulatorios: uno centrado en el transporte de vesículas ER-Golgi/dinámica citoesquelética, y otro en la transición G2/M/esplicing de ARN. Nuestros hallazgos delinean un marco modular de ZGA ovina y sugieren objetivos para mejorar la eficiencia reproductiva.