La integración generalizada de la inteligencia artificial en la actividad académica universitaria requiere abordar de manera responsable los desafíos éticos que plantea. Este estudio analiza críticamente estos desafíos, identificando oportunidades y riesgos en diversas disciplinas y prácticas académicas. Se realizó una revisión sistemática utilizando el método PRISMA de publicaciones desde enero de 2024 hasta enero de 2025. Basado en los trabajos seleccionados (n = 60), a través de un examen sistemático y riguroso, este estudio identifica desafíos éticos en la enseñanza y la investigación; oportunidades y riesgos de su integración en la práctica académica; herramientas específicas de inteligencia artificial categorizadas según el enfoque del estudio; y una contribución al debate actual, proporcionando criterios y pautas prácticas para los académicos. En conclusión, se puede afirmar que la integración de la IA ofrece oportunidades significativas, como la optimización de la investigación y el aprendizaje personalizado, así como riesgos humanos y éticos notables, incluyendo la pérdida del pensamiento crítico, la dependencia tecnológica y la homogeneización de ideas. Es esencial adoptar un enfoque consciente, con pautas claras que promuevan la supervisión humana, asegurando que la IA actúe como una herramienta de mejora en lugar de reemplazar el rendimiento humano inteligente, y que apoye la acción y el discernimiento humano en la creación de conocimiento.