Análisis del transcriptoma de células epiteliales limbares cultivadas sobre una membrana amniótica intacta tras almacenamiento hipotérmico en Optisol-GS
Autores: Paaske Utheim, Tor; Salvanos, Panagiotis; Aass Utheim, Øygunn; Ræder, Sten; Pasovic, Lara; Olstad, Ole Kristoffer; Fideliz de la Paz, Maria; Sehic, Amer
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2016
Acceso abierto
Artículo científico
2016
Análisis del transcriptoma de células epiteliales limbares cultivadas sobre una membrana amniótica intacta tras almacenamiento hipotérmico en Optisol-GS
Categoría
Ciencias de los Materiales
Subcategoría
Materiales para aplicaciones biomédicas
Palabras clave
Mecanismos moleculares
Almacenamiento hipotérmico
Expresión génica
Genes que codifican histonas
Muerte celular
Reparación del ADN
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
El objetivo del presente estudio fue investigar los mecanismos moleculares subyacentes a la activación de las vías de muerte celular utilizando un análisis transcripcional a nivel genómico en cultivos de células epiteliales limbares humanas (HLEC) tras almacenamiento hipotérmico convencional en Optisol-GS. Los cultivos de HLEC de tres semanas se almacenaron en Optisol-GS durante 2, 4 y 7 días a 4 grados Celsius. Se utilizó el software Partek Genomics Suite v.6.15.0422 (Partec Inc., St. Louis, MO, EE. UU.) para identificar genes que mostraron niveles de expresión significativamente diferentes (< 0.05) tras el almacenamiento hipotérmico en comparación con las láminas celulares no almacenadas. Hubo pocos cambios en la expresión génica después de 2 días de almacenamiento, pero varios genes fueron regulados de manera diferente tras 4 y 7 días de almacenamiento. Los genes que codifican histonas HIST1H3A y HIST4H4 estuvieron entre los genes más sobreexpresados tras 4 y 7 días de almacenamiento hipotérmico. El análisis bioinformático sugirió que estos dos genes están involucrados en una red funcional altamente asociada con la muerte celular, la necrosis y la transcripción de ARN. HDAC1, que codifica la histona desacetilasa 1, fue el gen más subexpresado después de 7 días de almacenamiento. Junto con otros genes subexpresados, se sugiere que HDAC1 está involucrado en una red reguladora significativamente asociada con la función y el mantenimiento celular, la diferenciación de células y la reparación del ADN. Nuestros datos sugieren que la sobreexpresión de genes que codifican histonas junto con genes subexpresados que afectan la diferenciación celular y la reparación del ADN pueden ser responsables del aumento de la muerte celular tras el almacenamiento hipotérmico de HLEC cultivadas. En resumen, nuestros resultados demostraron que un mayor número de genes cambiaron con el aumento del tiempo de almacenamiento. Además, en general, se observaron diferencias más grandes en los valores absolutos de expresión génica con el aumento del tiempo de almacenamiento. Una mayor comprensión de estos mecanismos moleculares es importante para la optimización de la tecnología de almacenamiento para láminas epiteliales limbares.
Descripción
El objetivo del presente estudio fue investigar los mecanismos moleculares subyacentes a la activación de las vías de muerte celular utilizando un análisis transcripcional a nivel genómico en cultivos de células epiteliales limbares humanas (HLEC) tras almacenamiento hipotérmico convencional en Optisol-GS. Los cultivos de HLEC de tres semanas se almacenaron en Optisol-GS durante 2, 4 y 7 días a 4 grados Celsius. Se utilizó el software Partek Genomics Suite v.6.15.0422 (Partec Inc., St. Louis, MO, EE. UU.) para identificar genes que mostraron niveles de expresión significativamente diferentes (< 0.05) tras el almacenamiento hipotérmico en comparación con las láminas celulares no almacenadas. Hubo pocos cambios en la expresión génica después de 2 días de almacenamiento, pero varios genes fueron regulados de manera diferente tras 4 y 7 días de almacenamiento. Los genes que codifican histonas HIST1H3A y HIST4H4 estuvieron entre los genes más sobreexpresados tras 4 y 7 días de almacenamiento hipotérmico. El análisis bioinformático sugirió que estos dos genes están involucrados en una red funcional altamente asociada con la muerte celular, la necrosis y la transcripción de ARN. HDAC1, que codifica la histona desacetilasa 1, fue el gen más subexpresado después de 7 días de almacenamiento. Junto con otros genes subexpresados, se sugiere que HDAC1 está involucrado en una red reguladora significativamente asociada con la función y el mantenimiento celular, la diferenciación de células y la reparación del ADN. Nuestros datos sugieren que la sobreexpresión de genes que codifican histonas junto con genes subexpresados que afectan la diferenciación celular y la reparación del ADN pueden ser responsables del aumento de la muerte celular tras el almacenamiento hipotérmico de HLEC cultivadas. En resumen, nuestros resultados demostraron que un mayor número de genes cambiaron con el aumento del tiempo de almacenamiento. Además, en general, se observaron diferencias más grandes en los valores absolutos de expresión génica con el aumento del tiempo de almacenamiento. Una mayor comprensión de estos mecanismos moleculares es importante para la optimización de la tecnología de almacenamiento para láminas epiteliales limbares.