Los fertilizantes nitrogenados han sido identificados en las ACVs de los cultivos energéticos como los principales contribuyentes al calentamiento global, así como a muchos otros impactos ambientales. El proceso de producción y las emisiones de aplicación distintas de los tipos de fertilizantes nitrogenados para la fertilización de cobertura producen diferentes ahorros de GEI cuando se comparan las cadenas de valor de los cultivos energéticos con las alternativas de energía fósil. En este estudio, se utilizaron tres tipos de fertilizantes (nitrato de amonio cálcico, urea y sulfato de amonio) en tasas de fertilización de cobertura de N de 80 kg N/ha para cultivar centeno para la generación de electricidad en las condiciones del clima Mediterráneo Continental del centro-norte de España. Se realizaron ACVs completas para toda la cadena de valor basadas en datos reales en conjunto con los balances de nitrógeno del suelo (SNBs) para evaluar el cumplimiento de los criterios de sostenibilidad de ahorro de GEI de la Unión Europea (UE), así como la sostenibilidad de las prácticas de fertilización para las existencias de nitrógeno en el suelo. Los resultados obtenidos pueden proporcionar ideas interesantes para la formulación de políticas, ya que el nitrato de amonio cálcico, el fertilizante más común para los cultivos de centeno, produjo ahorros de GEI del 66%, en contraposición al 69% logrado al aplicar urea y al 77% cuando se utilizó sulfato de amonio. Sin embargo, los tres fertilizantes produjeron déficits anuales de suelo superiores a 50 kg N/ha. Para garantizar ahorros por encima del 80%, como exige los criterios de sostenibilidad de la UE, y SNBs sostenibles, se deben tomar medidas de optimización adicionales en puntos clave de la cadena de valor.