Los simbiontes microbianos son considerados hoy en día de importancia fundamental para la vida animal. Entre los muchos procesos en los que están involucrados los microorganismos, una nueva línea de investigación se centra en su papel principal en la evolución de la comunicación química en sus hospedadores. Los volátiles de origen bacteriano pueden ser la base de la comunicación química y la transferencia de información social a través de señales, así como de información social inadvertida. Revisamos el papel de los microorganismos en la comunicación animal entre conspecíficos y, dado que el microbioma puede causar efectos beneficiosos así como perjudiciales en sus hospedadores animales, también revisamos su papel en la determinación del resultado de las interacciones con parásitos y depredadores. Finalmente, prestamos especial atención al papel hipotético de la depredación y el parasitismo en la evolución del microbioma animal. Destacamos la novedad del marco teórico derivado de considerar la microbiota de los animales en escenarios de comunicación, parasitismo y depredación. Nuestro objetivo fue fomentar la investigación en estas áreas, sugiriendo predicciones clave que deben ser probadas para comprender mejor cuál es uno de los principales roles de las bacterias en la biología animal.