El objetivo de este estudio fue evaluar la concentración y distribución de varios macro y micronutrientes en respuesta a la imbibición en semillas de chile habanero extraídas de frutos con diferentes etapas de madurez y tiempos de almacenamiento postcosecha, así como en sus plántulas. Los frutos fueron cosechados verdes, medio maduros y maduros, y fueron sometidos a almacenamiento durante 0 (control), 7 y 14 días postcosecha antes de la extracción de las semillas. Se realizó un análisis de microfluorescencia de rayos X en semillas antes y después de la imbibición, así como en plántulas a los 10 y 14 días después de la siembra. K, Ca, Fe, P, Mg y Mn fueron detectados mediante análisis elemental. Los resultados indicaron que los elementos tenían una mayor concentración y distribución en semillas extraídas de frutos medio maduros y maduros no almacenados, así como en semillas extraídas de frutos almacenados durante 7 y 14 días postcosecha. K y Ca fueron los elementos con las distribuciones y concentraciones más altas en semillas y plántulas antes y después de la imbibición en comparación con los otros elementos. En todas las etapas de madurez, el almacenamiento postcosecha aumentó la concentración y distribución de nutrientes minerales en semillas y plántulas antes y después de la imbibición. El almacenamiento translocó elementos minerales a la radícula antes de la germinación, aumentó el crecimiento del meristemo en las plántulas emergidas, disminuyó la conductividad eléctrica y aumentó la germinación. Catorce días de almacenamiento postcosecha aumentaron la distribución de macro y micronutrientes en semillas inmaduras, disminuyendo la conductividad eléctrica, potenciando la germinación y mejorando la distribución de elementos minerales en las plántulas.