En Nueva Zelanda, durante los períodos más calurosos del año, algunas granjas de salmón en los Marlborough Sounds alcanzan temperaturas del agua por encima del rango óptimo para el salmón Chinook. Se registran altos niveles de mortalidad durante estos períodos, lo que enfatiza la importancia de comprender el estrés térmico en esta especie. En este estudio, se investigaron las respuestas del salmón Chinook a cambios crónicos y a largo plazo en la temperatura y el oxígeno disuelto. Esta es una investigación única debido a la duración de los eventos de estrés a los que fueron expuestos los peces. Se analizaron parámetros de salud y hematológicos junto con los resultados de expresión génica para determinar los efectos del estrés térmico en el salmón Chinook. Se descubrieron y caracterizaron seis copias de la proteína de choque térmico 90 (HSP90): HSP90AA1.1a, HSP90AA1.2a, HSP90AA1.1b, HSP90AA1.2b, HSP90AB1a y HSP90AB1b, así como dos copias de SOD1, llamadas SOD1a y SOD1b. Las secuencias de aminoácidos contenían características similares a las que se encuentran en otras secuencias de HSP90 y SOD1 de vertebrados, y el árbol filogenético y el análisis de sintecnía proporcionaron evidencia concluyente de su relación con otros genes de HSP90 y SOD1 de vertebrados. Se diseñaron cebadores para qPCR para permitir el análisis de la expresión de todas las copias de HSP90 y SOD1. Los estudios de expresión mostraron que HSP90 y SOD1 estaban regulados a la baja en el hígado y el bazo en respuesta a la exposición a largo plazo a altas temperaturas y bajo oxígeno disuelto. HSP90 también se reguló a la baja en las branquias; sin embargo, los resultados de la expresión de SOD1 en las branquias no fueron concluyentes. Este estudio proporciona información importante sobre las respuestas fisiológicas y genéticas del salmón Chinook al estrés por temperatura y oxígeno, que son críticas para desarrollar una acuicultura pesquera sostenible en una era de cambios climáticos globales.