Los factores gaseosos afectan los procesos fisiológicos post-cosecha en cultivos hortícolas, incluyendo flores ornamentales. Sin embargo, las respuestas moleculares de las flores cortadas a las condiciones de bajo oxígeno asociadas con el envasado en atmósfera modificada (MAP) aún no se han elucidado. Aquí, mostramos que el almacenamiento de flores de clavel cortadas en una bolsa de polipropileno sellada disminuyó la concentración de oxígeno en la bolsa al 3-5% y ralentizó la apertura de las flores. La vida en jarrón de las flores de clavel después de un almacenamiento de siete días en condiciones de MAP fue comparable a la de aquellas sin almacenamiento y se mejoró con la aplicación de un conservante de calidad comercial. La carga de energía de adenilato (AEC) se mantuvo en niveles altos en los pétalos de las flores almacenadas bajo condiciones de MAP. Esto fue acompañado por la regulación al alza de cuatro genes relacionados con la hipoxia, entre los cuales se identificaron recientemente los genes FACTOR DE RESPUESTA AL ETILENO RESPONDEDOR A LA HIPOXIA y FITOGLOBINA. Estos resultados sugieren que los genes sensibles a la hipoxia contribuyen al mantenimiento del estado energético en las flores de clavel almacenadas bajo condiciones de MAP, lo que hace que esta técnica de control de gases sea potencialmente efectiva para mantener la calidad de las flores cortadas sin refrigeración.