Como portadores de contacto directo entre las plantas y el ambiente atmosférico, los microbiomas de los microorganismos de la filósfera son cada vez más reconocidos como un área importante de estudio. La secreción de sal provocada por halófitos que secretan sal provoca cambios en la estructura de la comunidad y en las funciones de los microorganismos de la filósfera, y a menudo proporciona retroalimentación positiva al ambiente de la planta/comunidad individual. En este estudio, los contenidos de Na y K en la rizósfera, planta y filósfera aumentaron bajo estrés de 200 mmol/L de NaCl. El aumento en la conductividad eléctrica, Na y K en la filósfera no solo disminuyó la diversidad de las comunidades bacterianas y fúngicas, sino que también disminuyó la abundancia relativa de Actinobacteriota y Basidiomycota. Influenciados por la conductividad eléctrica y Na, la red de co-ocurrencia de bacterias y hongos bajo estrés salino tiene una mayor complejidad. Los cambios en la estructura de la comunidad microbiana de la filósfera resultaron en un aumento significativo de la abundancia relativa de grupos de fuentes de energía bacteriana y grupos patotróficos fúngicos. La abundancia relativa de Actinobacteriota y Acidobacteriota en la rizósfera mostró una tendencia a la disminución bajo estrés salino, mientras que la complejidad de la red de co-ocurrencia de la rizósfera fue mayor que la del control. Además, las abundancias relativas de grupos funcionales de bacterias de la rizósfera en el ciclo del carbono y el ciclo del fósforo aumentaron significativamente bajo estrés, y estaban significativamente correlacionadas con la conductividad eléctrica y Na. Este estudio investigó los efectos de la salinidad en la estructura y propiedades fisicoquímicas de las comunidades microbianas de la filósfera y la rizósfera de halófitos, y destaca el papel de los microbios de la filósfera como indicadores ecológicos en las respuestas de las plantas a ambientes estresantes.