El cormorán mediterráneo es un ave marina endémica del mar Mediterráneo y del mar Negro, que recientemente ha sido incluida en la lista de especies amenazadas de la UICN. La mayoría de las colonias reproductivas se encuentran en Cerdeña y en islotes circundantes. La captura incidental en redes de pesca es una de las amenazas más significativas para esta población. Nuestro trabajo tuvo como objetivo evaluar las alteraciones en la proporción de sexos causadas por la captura incidental y estudiar la respuesta adaptativa de la población a una proporción de sexos adultos sesgada. La proporción de sexos de los cormoranes mediterráneos encontrados ahogados en las redes de enmalle cerca de las colonias y la de los polluelos de la colonia de Corcelli (noreste de Cerdeña) se determinó utilizando el polimorfismo ligado al sexo del gen Chromobox-Helicase-DNA-binding 1. Los datos de los cormoranes encontrados ahogados en las redes evidenciaron una alta tasa de mortalidad (83.3%; < 0.001) y un mayor tamaño de los machos (35% más pesados que las hembras, < 0.05) en comparación con las hembras, lo que apoya la teoría de que los individuos más pesados son capaces de forrajear a grandes profundidades. Con un 64.8% de los polluelos siendo machos, la proporción de sexos de los polluelos fue estadísticamente diferente de la paridad (< 0.05). Además, estaba relacionada con el tamaño de la nidada. En nidadas de uno y dos polluelos, el 73% y el 70% de los polluelos, respectivamente, eran machos, mientras que en nidadas de tres polluelos, solo el 33% eran machos. Nuestros datos identifican la mayor tasa de cormoranes machos ahogados en redes de enmalle como un factor que causa una alteración de la proporción de sexos en la población de cormoranes mediterráneos. Según la Teoría de Asignación de Sexos, un ajuste adaptativo del sexo realizado por las hembras adultas restaura la proporción de sexos mendeliana en la población.