En las áreas de cultivo de arroz de Kenia, las variedades Basmati se han producido en monocultivo desde finales de la década de 1980. Esto ha resultado en la ruptura de la respuesta mediada por el gen de resistencia (R) de las variedades Basmati locales a la enfermedad del tizón causada por. Para mejorar la resistencia al tizón en las variedades Basmati de Kenia, es necesaria la identificación continua de genes R y materiales de cría adecuados para Basmati. Se espera que las líneas de introgressión de segmentos cromosómicos Longistaminata (LCSILs) con el fondo genético de Kernel Basmati, desarrolladas utilizando una línea de arroz llamada potencial adaptable de bajo insumo-1 (pLIA-1) derivada de un cruce entre Taichung 65 (T65) (una variedad de arroz del grupo Japonica) y, contengan genes R útiles contra el tizón derivados de o T65. En este estudio, investigamos la variación genética de los genes R contra el tizón en LCSILs y sus padres utilizando un nuevo sistema internacional diferencial para designar razas de tizón basado en la teoría del gen por gen y caracterización molecular utilizando marcadores de polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Los LCSILs y sus padres se clasificaron en tres grupos: A, B1 y B2, según los patrones de reacción a los aislamientos estándar diferenciales de tizón (SDBIs). El grupo A, que incluye pLIA-1, mostró la mayor resistencia en todos los grupos, seguido por los grupos B1 y B2. El Kernel Basmati en el grupo B1 se consideró que poseía o (t), (t) y otros genes R desconocidos. Además de estos genes R, se determinó que LCSIL 6, 12, 27, 28 y 40, en el grupo A, poseían uno de, , o ambos genes que confieren resistencia a las razas de tizón de Kenia. Estas líneas pueden ser utilizadas para apilar de manera eficiente los genes R contra el tizón en las variedades Basmati locales.