La nuez china es una especie de árbol importante para la agricultura, pero la enfermedad de la pudrición seca, causada por , amenaza su viabilidad. Para estudiar las interacciones entre el árbol y el patógeno, se realizó una secuenciación transcriptómica en tejidos infectados y sanos de nuez cultivada en campo. El análisis de expresión génica diferencial identificó vías de defensa clave y genes activados durante la infección. El estudio también exploró los roles de los ARN no codificantes, como los lncARN y circARN, en la defensa del árbol. Los resultados mostraron que durante las etapas tempranas y medias de la infección, el árbol se defiende a través de mecanismos como la síntesis de lignina mejorada y el aumento de la actividad de la peroxidasa. Los ARN no codificantes contribuyen a la resistencia a enfermedades al reforzar la pared celular, aumentar la actividad de la oxidasa y promover la síntesis de metabolitos secundarios relacionados con antibióticos. Además, los patrones de expresión génica en estas etapas difieren significativamente de los de la etapa tardía de la infección, cuando la mayoría de las vías de resistencia a enfermedades están suprimidas y genes como y muestran un declive. Estos hallazgos ofrecen valiosas perspectivas sobre la patogénesis de la enfermedad de la pudrición seca de la nuez china y estrategias potenciales para mejorar la resistencia.