El agua de mar desalinizada (DSW) puede proporcionar recursos hídricos para la irrigación en regiones costeras donde escasea el agua dulce. La ósmosis inversa (RO) es la técnica más común para obtener DSW a nivel mundial. Sin embargo, el uso de DSW para la irrigación podría plantear un riesgo agronómico ya que los permeados de RO pueden tener una concentración de boro por encima de los umbrales de fitotoxicidad de ciertos cultivos, como los cultivos leñosos (0,5 a 1,0 mg/L). En este estudio, se evaluó desde una perspectiva técnica y económica un sistema de resina de intercambio iónico en la finca con un flujo promedio de 1 m/h, diseñado para reducir la concentración de boro de DSW. Se evaluó el impacto de las variaciones en la temperatura del agua de alimentación y de operación en el proceso de reducción de boro. Los resultados muestran que el sistema puede proporcionar un efluente con una concentración de boro por debajo del umbral de 0,5 mg/L durante 92 h de operación, con rechazos de boro de hasta el 99% durante las primeras 41 h. El costo estimado de eliminación de boro con el sistema de la prueba en la finca fue de 0,992 EUR/m. Sin embargo, se espera que este costo disminuya a 0,226 EUR/m para una planta comercial de resina de intercambio iónico (IX) (20 m/h), destacando la importancia del factor de escala. Nuestros resultados ofrecen una guía novedosa sobre la viabilidad de utilizar sistemas de eliminación de boro IX para fincas irrigadas con DSW, cuando esta es proporcionada por plantas costeras con concentraciones de boro por encima de la tolerancia del cultivo.